36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1570 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 		 1043 aa  1981    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  30.96 
 
 		 1045 aa  263  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.44 
 
 		 1048 aa  92.8  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.46 
 
 		 1049 aa  84  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  36.07 
 
 		 1029 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  35.25 
 
 		 1029 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.32 
 
 		 968 aa  62.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  32.3 
 
 		 1014 aa  62.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  19.49 
 
 		 1158 aa  61.6  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1151 aa  61.6  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.94 
 
 		 1149 aa  60.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  19.72 
 
 		 1158 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1356  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.32 
 
 		 935 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08480  RecB family exonuclease  26.34 
 
 		 889 aa  57.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  29.54 
 
 		 1151 aa  55.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  24.85 
 
 		 865 aa  55.5  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  22.67 
 
 		 1019 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1079 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  25.58 
 
 		 1186 aa  53.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  25.46 
 
 		 1149 aa  52  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  24.78 
 
 		 990 aa  51.6  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1039 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.13 
 
 		 1146 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  31.75 
 
 		 984 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  26.97 
 
 		 1124 aa  50.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  24.3 
 
 		 915 aa  49.7  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  22.41 
 
 		 1140 aa  49.7  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0871  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1042 aa  48.9  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.124792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05990  hypothetical protein  26.64 
 
 		 906 aa  48.5  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0344259  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  27.66 
 
 		 259 aa  47  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  29.22 
 
 		 962 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.86 
 
 		 836 aa  45.8  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  26.89 
 
 		 1043 aa  45.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  26.86 
 
 		 997 aa  45.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.56 
 
 		 947 aa  45.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  27.83 
 
 		 991 aa  45.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>