53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1856 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.01 
 
 
1171 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  32.65 
 
 
1170 aa  659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  36.03 
 
 
1155 aa  762    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  33.17 
 
 
1171 aa  672    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.36 
 
 
1149 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  35.5 
 
 
1165 aa  764    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  100 
 
 
1186 aa  2431    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.09 
 
 
1171 aa  684    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.17 
 
 
1171 aa  676    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.92 
 
 
1171 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  33.66 
 
 
1218 aa  667    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  36.31 
 
 
1151 aa  768    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  34.85 
 
 
1171 aa  730    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  33.28 
 
 
1171 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.39 
 
 
1171 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.92 
 
 
1171 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  33.28 
 
 
1171 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  34.55 
 
 
1172 aa  715    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.17 
 
 
1171 aa  683    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.27 
 
 
1146 aa  630  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  31.65 
 
 
1149 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  30.29 
 
 
1158 aa  571  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  29.61 
 
 
1158 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  28.23 
 
 
1124 aa  519  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  29.75 
 
 
1171 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  27.3 
 
 
1157 aa  449  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  27.3 
 
 
1157 aa  449  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  28.04 
 
 
1159 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.9 
 
 
1260 aa  286  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.72 
 
 
1121 aa  268  4e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.11 
 
 
1161 aa  255  4.0000000000000004e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.42 
 
 
1159 aa  248  4.9999999999999997e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.66 
 
 
1158 aa  243  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.17 
 
 
1169 aa  236  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.89 
 
 
1099 aa  197  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  22.35 
 
 
1106 aa  154  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  21.83 
 
 
1077 aa  142  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.8 
 
 
1049 aa  76.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  20.56 
 
 
994 aa  73.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  29.74 
 
 
1029 aa  71.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.54 
 
 
1113 aa  65.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.24 
 
 
986 aa  65.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.69 
 
 
968 aa  62  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.09 
 
 
1029 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  22.06 
 
 
990 aa  53.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.59 
 
 
1043 aa  52.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  22.72 
 
 
865 aa  48.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1402  hypothetical protein  23.95 
 
 
769 aa  46.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.024307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.01 
 
 
1051 aa  46.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27.55 
 
 
1045 aa  45.8  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3865  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 
689 aa  45.8  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25.7 
 
 
856 aa  45.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  33.06 
 
 
727 aa  45.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>