58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00780 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  100 
 
 		 990 aa  2034    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  32.49 
 
 		 968 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08480  RecB family exonuclease  28.8 
 
 		 889 aa  337  5.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0871  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1042 aa  197  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.124792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  28.69 
 
 		 1045 aa  68.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  28.57 
 
 		 856 aa  68.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  28.51 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  30.57 
 
 		 846 aa  63.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  28.83 
 
 		 1029 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  26.95 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  28.33 
 
 		 1043 aa  56.2  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.84 
 
 		 957 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  22.06 
 
 		 1186 aa  53.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  25.11 
 
 		 994 aa  52.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.83 
 
 		 958 aa  52.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  28.65 
 
 		 896 aa  52  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  30.86 
 
 		 323 aa  52  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  24.52 
 
 		 976 aa  52.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.66 
 
 		 986 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.23 
 
 		 1029 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  27.16 
 
 		 984 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  27.01 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  22.17 
 
 		 915 aa  50.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.32 
 
 		 1121 aa  49.3  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  28.42 
 
 		 1052 aa  49.7  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  26.67 
 
 		 913 aa  49.3  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  29.15 
 
 		 858 aa  48.9  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1052 aa  48.5  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  26.55 
 
 		 856 aa  48.5  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0086  hypothetical protein  25.25 
 
 		 945 aa  48.5  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  27.87 
 
 		 1052 aa  48.5  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  26.55 
 
 		 856 aa  48.5  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.18 
 
 		 916 aa  48.5  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  27.75 
 
 		 986 aa  48.5  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  25.24 
 
 		 912 aa  48.5  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  28.24 
 
 		 273 aa  48.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  29.12 
 
 		 1049 aa  48.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.53 
 
 		 1043 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.07 
 
 		 962 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  23.86 
 
 		 951 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  22.17 
 
 		 911 aa  47.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.69 
 
 		 915 aa  47.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.12 
 
 		 1049 aa  47.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.35 
 
 		 1048 aa  47.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  28.25 
 
 		 922 aa  47  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  28.64 
 
 		 858 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  26.52 
 
 		 947 aa  45.8  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25 
 
 		 1146 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1049 aa  45.8  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  28.65 
 
 		 379 aa  45.8  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  28.33 
 
 		 865 aa  45.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0420  hypothetical protein  20.93 
 
 		 966 aa  45.4  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.8 
 
 		 989 aa  45.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  27.01 
 
 		 940 aa  45.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  23.39 
 
 		 1140 aa  45.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  25.56 
 
 		 1054 aa  45.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  29.31 
 
 		 1001 aa  44.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.42 
 
 		 1169 aa  44.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>