28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3877 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  89.62 
 
 		 1100 aa  1796    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  100 
 
 		 1151 aa  2181    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  88.99 
 
 		 1079 aa  1726    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.27 
 
 		 1048 aa  88.2  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  20.89 
 
 		 994 aa  76.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.24 
 
 		 1049 aa  72.4  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.34 
 
 		 1043 aa  70.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  26.79 
 
 		 780 aa  67.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 1019 aa  63.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  29.23 
 
 		 1060 aa  61.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  31 
 
 		 1045 aa  61.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  29.21 
 
 		 976 aa  60.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  23.89 
 
 		 960 aa  55.1  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.86 
 
 		 957 aa  54.3  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  27.97 
 
 		 997 aa  52  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1996  hypothetical protein  27.19 
 
 		 884 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.573803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  23.57 
 
 		 781 aa  51.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.26 
 
 		 951 aa  50.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0036  hypothetical protein  27.69 
 
 		 886 aa  49.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2986  hypothetical protein  28.63 
 
 		 884 aa  48.9  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.262988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  31.31 
 
 		 277 aa  48.9  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  24.88 
 
 		 969 aa  48.5  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  24.88 
 
 		 969 aa  48.5  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  31.31 
 
 		 277 aa  48.9  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  31.31 
 
 		 277 aa  48.9  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  26.51 
 
 		 962 aa  47.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  27.5 
 
 		 266 aa  46.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  29.49 
 
 		 291 aa  45.8  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>