26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4020 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  100 
 
 
1079 aa  2057    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  88.99 
 
 
1151 aa  1740    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  92.55 
 
 
1100 aa  1850    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.12 
 
 
1048 aa  91.7  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.18 
 
 
994 aa  77  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.47 
 
 
1049 aa  67.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.59 
 
 
1043 aa  66.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  26.07 
 
 
780 aa  63.9  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 
1019 aa  62  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  29.97 
 
 
976 aa  60.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  27.55 
 
 
1060 aa  56.6  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  28.11 
 
 
1045 aa  55.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.2 
 
 
957 aa  53.5  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.27 
 
 
962 aa  52  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0036  hypothetical protein  28.35 
 
 
886 aa  51.6  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1996  hypothetical protein  26.82 
 
 
884 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.573803  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  23.17 
 
 
960 aa  48.5  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  25.36 
 
 
1052 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  25.17 
 
 
951 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2986  hypothetical protein  28.22 
 
 
884 aa  47  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.262988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  30.69 
 
 
997 aa  47.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  24.93 
 
 
947 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  27.96 
 
 
379 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  25 
 
 
969 aa  45.8  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  25 
 
 
969 aa  45.8  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  23.38 
 
 
781 aa  45.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>