49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2513 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1356  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  60.7 
 
 		 935 aa  699    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  100 
 
 		 1029 aa  1830    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  92.03 
 
 		 1029 aa  1102    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.64 
 
 		 1049 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.93 
 
 		 1113 aa  114  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  19.35 
 
 		 1186 aa  102  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  24.18 
 
 		 1172 aa  97.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  22.43 
 
 		 1124 aa  94  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  21.71 
 
 		 1140 aa  92.8  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  30.83 
 
 		 1151 aa  85.5  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.05 
 
 		 1146 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  22.38 
 
 		 1171 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.76 
 
 		 994 aa  83.2  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.68 
 
 		 1155 aa  81.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  32.41 
 
 		 1045 aa  77  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  35.27 
 
 		 1043 aa  74.3  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  22.32 
 
 		 1149 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.63 
 
 		 1171 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  25.05 
 
 		 1218 aa  73.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.63 
 
 		 1171 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.63 
 
 		 1171 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  21.57 
 
 		 1171 aa  72  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  21.58 
 
 		 1171 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  21.58 
 
 		 1171 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.52 
 
 		 1171 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  24.09 
 
 		 865 aa  69.7  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.41 
 
 		 1171 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.28 
 
 		 1171 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  25.59 
 
 		 915 aa  67  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.09 
 
 		 1171 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.78 
 
 		 1169 aa  65.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  23.28 
 
 		 1170 aa  64.7  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.32 
 
 		 990 aa  61.2  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.96 
 
 		 968 aa  60.1  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.19 
 
 		 1048 aa  58.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.9 
 
 		 957 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.05 
 
 		 986 aa  58.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  28.46 
 
 		 984 aa  57.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  25.06 
 
 		 962 aa  57  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  29.23 
 
 		 976 aa  54.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  30.52 
 
 		 1171 aa  52.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  31.03 
 
 		 1001 aa  52  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  33.14 
 
 		 864 aa  49.7  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  33.49 
 
 		 1165 aa  49.3  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.25 
 
 		 836 aa  48.9  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  28.3 
 
 		 1000 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  30.54 
 
 		 856 aa  46.2  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.25 
 
 		 773 aa  45.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  30.41 
 
 		 883 aa  44.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>