46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3424 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  32.33 
 
 		 1149 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.28 
 
 		 1146 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  32.11 
 
 		 1155 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  31.86 
 
 		 1124 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  100 
 
 		 1171 aa  2409    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  31.71 
 
 		 1165 aa  635  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.75 
 
 		 1171 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.5 
 
 		 1171 aa  625  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.39 
 
 		 1171 aa  625  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  31.07 
 
 		 1149 aa  621  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.11 
 
 		 1171 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.42 
 
 		 1171 aa  621  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  33.42 
 
 		 1171 aa  619  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  33.92 
 
 		 1171 aa  618  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  33.42 
 
 		 1171 aa  619  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.33 
 
 		 1171 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.42 
 
 		 1171 aa  619  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  32.43 
 
 		 1172 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  32.77 
 
 		 1170 aa  602  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  31.14 
 
 		 1151 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  32.02 
 
 		 1171 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  30.72 
 
 		 1158 aa  582  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  30.63 
 
 		 1158 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  28.34 
 
 		 1218 aa  522  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  29.75 
 
 		 1186 aa  506  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  26.61 
 
 		 1157 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  26.61 
 
 		 1157 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  25.89 
 
 		 1159 aa  386  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.56 
 
 		 1121 aa  291  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.18 
 
 		 1260 aa  288  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.96 
 
 		 1159 aa  234  9e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.75 
 
 		 1169 aa  221  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.34 
 
 		 1161 aa  210  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  20.58 
 
 		 1158 aa  208  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.23 
 
 		 1099 aa  190  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  20.98 
 
 		 1106 aa  141  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  19.41 
 
 		 1077 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.68 
 
 		 986 aa  58.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.41 
 
 		 1113 aa  55.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.63 
 
 		 1048 aa  54.3  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  28.97 
 
 		 1029 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.13 
 
 		 994 aa  50.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  20.47 
 
 		 1045 aa  48.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.1 
 
 		 1049 aa  46.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  25 
 
 		 915 aa  45.1  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.84 
 
 		 1029 aa  44.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>