45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2077 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 
1169 aa  2333    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.28 
 
 
1171 aa  294  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.54 
 
 
1171 aa  291  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  24.67 
 
 
1170 aa  289  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.19 
 
 
1171 aa  289  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.4 
 
 
1171 aa  288  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.32 
 
 
1171 aa  288  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  24.57 
 
 
1171 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  24.57 
 
 
1171 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.46 
 
 
1171 aa  287  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.23 
 
 
1171 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  24.46 
 
 
1171 aa  282  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.68 
 
 
1165 aa  280  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.56 
 
 
1155 aa  277  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  25.12 
 
 
1171 aa  268  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  29.02 
 
 
1151 aa  258  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  26.06 
 
 
1172 aa  257  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  23.67 
 
 
1218 aa  250  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  22.91 
 
 
1186 aa  243  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  22.85 
 
 
1171 aa  237  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  21.44 
 
 
1158 aa  230  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  21.82 
 
 
1157 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  21.82 
 
 
1157 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  21.5 
 
 
1159 aa  229  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.71 
 
 
1158 aa  228  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.91 
 
 
1149 aa  217  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.71 
 
 
1146 aa  210  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  23.03 
 
 
1124 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  18.96 
 
 
1149 aa  152  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.37 
 
 
1161 aa  145  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  21 
 
 
1159 aa  131  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.02 
 
 
1260 aa  129  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  18.97 
 
 
1099 aa  126  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  20.34 
 
 
1158 aa  110  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  19.42 
 
 
1106 aa  108  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  20.73 
 
 
1077 aa  100  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  18.15 
 
 
1121 aa  99.4  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.54 
 
 
1048 aa  55.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  29.29 
 
 
855 aa  53.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.99 
 
 
1113 aa  52.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  26.87 
 
 
858 aa  49.3  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  26.37 
 
 
846 aa  47.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.65 
 
 
989 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  26.87 
 
 
858 aa  45.1  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.42 
 
 
990 aa  44.7  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>