70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0645 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 		 989 aa  1952    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.24 
 
 		 957 aa  265  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1018 aa  72  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.8 
 
 		 951 aa  72  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1016 aa  66.6  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  27.6 
 
 		 977 aa  66.6  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  26.46 
 
 		 1049 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  27.36 
 
 		 947 aa  64.7  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  28.19 
 
 		 976 aa  63.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  28.62 
 
 		 962 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  29.81 
 
 		 984 aa  60.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  26.77 
 
 		 1000 aa  59.7  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1049 aa  59.7  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1049 aa  58.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  28.51 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.76 
 
 		 1042 aa  58.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  29.88 
 
 		 959 aa  58.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  29.01 
 
 		 991 aa  58.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  26.43 
 
 		 1001 aa  57.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  32.75 
 
 		 846 aa  57.4  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  21.04 
 
 		 951 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  23.86 
 
 		 919 aa  55.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1048 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.15 
 
 		 1048 aa  55.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  28.12 
 
 		 997 aa  54.7  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  28.25 
 
 		 993 aa  54.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.64 
 
 		 957 aa  53.9  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  25.74 
 
 		 997 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  24.73 
 
 		 1059 aa  53.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  28.08 
 
 		 997 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  24.37 
 
 		 1064 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  20.89 
 
 		 781 aa  53.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  23.74 
 
 		 960 aa  52.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  27.03 
 
 		 1014 aa  52.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  27.47 
 
 		 988 aa  52  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  30.3 
 
 		 856 aa  52  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  30.3 
 
 		 856 aa  51.6  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  24.01 
 
 		 1064 aa  51.6  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0086  hypothetical protein  23.94 
 
 		 945 aa  50.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1042 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.74 
 
 		 958 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1100 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.47 
 
 		 1159 aa  50.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  27.42 
 
 		 865 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 915 aa  49.7  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  29.74 
 
 		 883 aa  49.3  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  26.48 
 
 		 980 aa  49.7  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  30.81 
 
 		 856 aa  49.3  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0420  hypothetical protein  20.08 
 
 		 966 aa  48.5  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  17.42 
 
 		 803 aa  48.5  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  27.55 
 
 		 1151 aa  48.5  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  26.75 
 
 		 991 aa  48.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1052 aa  48.1  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.81 
 
 		 780 aa  47.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  21.34 
 
 		 969 aa  47.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  21.34 
 
 		 969 aa  47.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  23.22 
 
 		 1052 aa  47.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.51 
 
 		 915 aa  47.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  25.27 
 
 		 1076 aa  46.6  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  21.56 
 
 		 994 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.52 
 
 		 908 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.65 
 
 		 1169 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.8 
 
 		 990 aa  45.8  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1053 aa  45.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  23.5 
 
 		 1171 aa  45.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1578  hypothetical protein  28.13 
 
 		 753 aa  45.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.81 
 
 		 836 aa  45.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  24.54 
 
 		 1052 aa  45.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  24.77 
 
 		 1054 aa  44.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  28.98 
 
 		 855 aa  44.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>