66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3435 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  46.86 
 
 		 1001 aa  779    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  100 
 
 		 1018 aa  1968    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  41.71 
 
 		 1042 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  40.55 
 
 		 1049 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  40.73 
 
 		 1048 aa  595  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  40.6 
 
 		 1049 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  40.33 
 
 		 1049 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1048 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  41.8 
 
 		 1014 aa  568  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  40.09 
 
 		 1053 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  38.14 
 
 		 1052 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  38.94 
 
 		 1052 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  41.3 
 
 		 1015 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  38.94 
 
 		 1052 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  40.28 
 
 		 1042 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  40.9 
 
 		 1037 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  39.83 
 
 		 1040 aa  522  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  39.17 
 
 		 999 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  39.38 
 
 		 991 aa  505  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  38.21 
 
 		 1047 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  38.3 
 
 		 1047 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  38.25 
 
 		 1045 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  38.22 
 
 		 1043 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  36.12 
 
 		 1064 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  38.46 
 
 		 1054 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  37.2 
 
 		 1016 aa  477  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  36.25 
 
 		 1064 aa  475  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  36.38 
 
 		 1059 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  33.46 
 
 		 1047 aa  468  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  35.12 
 
 		 1076 aa  465  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  36.15 
 
 		 993 aa  465  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  35.77 
 
 		 1062 aa  462  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  37.63 
 
 		 991 aa  432  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  36.25 
 
 		 1000 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  37.38 
 
 		 997 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  34.79 
 
 		 977 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  37.1 
 
 		 997 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  34.57 
 
 		 986 aa  402  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  37.06 
 
 		 959 aa  396  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  34.33 
 
 		 988 aa  389  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  33.59 
 
 		 980 aa  331  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  21.34 
 
 		 911 aa  212  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  21.06 
 
 		 914 aa  207  7e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  23.25 
 
 		 890 aa  205  4e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  28.57 
 
 		 779 aa  86.3  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.09 
 
 		 957 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.54 
 
 		 947 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.1 
 
 		 989 aa  73.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  28.18 
 
 		 962 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  21.34 
 
 		 909 aa  68.6  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  22.78 
 
 		 781 aa  67  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  21.67 
 
 		 911 aa  65.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.94 
 
 		 836 aa  62.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 846 aa  55.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.77 
 
 		 788 aa  53.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  34.25 
 
 		 913 aa  52.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  28.74 
 
 		 1151 aa  49.7  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.4 
 
 		 915 aa  49.3  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  30.99 
 
 		 864 aa  49.3  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  27.18 
 
 		 856 aa  48.5  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  40.22 
 
 		 142 aa  48.5  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  25 
 
 		 968 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  26.98 
 
 		 1106 aa  47.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 		 1016 aa  47.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  25.91 
 
 		 1077 aa  46.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 915 aa  44.7  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>