72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2795 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  45.95 
 
 		 977 aa  735    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  43.38 
 
 		 986 aa  644    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  100 
 
 		 980 aa  1914    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  50.81 
 
 		 997 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  50.66 
 
 		 1000 aa  804    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  50.41 
 
 		 997 aa  793    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  43.4 
 
 		 988 aa  621  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  34.01 
 
 		 1001 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  32.2 
 
 		 1052 aa  355  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  32.38 
 
 		 1059 aa  346  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  31.34 
 
 		 1052 aa  336  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1052 aa  334  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  33.33 
 
 		 999 aa  330  8e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.74 
 
 		 1048 aa  328  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  34.33 
 
 		 1047 aa  327  8.000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  33.62 
 
 		 1045 aa  326  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  31.24 
 
 		 1064 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  34.21 
 
 		 1047 aa  324  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1053 aa  319  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  32.68 
 
 		 1076 aa  318  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1042 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  34.86 
 
 		 1037 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1049 aa  313  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1018 aa  312  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.4 
 
 		 1042 aa  310  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  30.68 
 
 		 1062 aa  310  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  31.49 
 
 		 1064 aa  310  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  33.67 
 
 		 1049 aa  300  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  33.11 
 
 		 1015 aa  294  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  34.05 
 
 		 1040 aa  293  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  34.2 
 
 		 1054 aa  288  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  27.99 
 
 		 1047 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  32.5 
 
 		 991 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1016 aa  275  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  31.05 
 
 		 993 aa  270  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  32.45 
 
 		 991 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  32.71 
 
 		 1014 aa  254  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1048 aa  210  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  32.84 
 
 		 959 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  37.17 
 
 		 1049 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  30.95 
 
 		 1043 aa  124  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  19.77 
 
 		 914 aa  124  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  19.31 
 
 		 911 aa  111  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  27.74 
 
 		 864 aa  93.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  26.1 
 
 		 890 aa  84.3  0.000000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.19 
 
 		 836 aa  80.5  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  27.39 
 
 		 855 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.04 
 
 		 962 aa  75.5  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.24 
 
 		 947 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  26.95 
 
 		 856 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  24.9 
 
 		 779 aa  63.2  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  25.62 
 
 		 976 aa  61.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  30.53 
 
 		 883 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  27.22 
 
 		 856 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.34 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  27 
 
 		 856 aa  58.9  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  30 
 
 		 846 aa  58.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27.78 
 
 		 908 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.41 
 
 		 989 aa  53.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.5 
 
 		 1048 aa  53.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  24.18 
 
 		 780 aa  51.6  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.13 
 
 		 1049 aa  50.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  29.61 
 
 		 896 aa  49.7  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  35.63 
 
 		 940 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.65 
 
 		 986 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  32.89 
 
 		 1045 aa  47  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.86 
 
 		 957 aa  47.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  27.21 
 
 		 913 aa  46.2  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.5 
 
 		 958 aa  45.8  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.38 
 
 		 916 aa  45.8  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.28 
 
 		 940 aa  45.8  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  27.53 
 
 		 912 aa  44.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>