64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0467 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  100 
 
 		 912 aa  1802    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  43.81 
 
 		 940 aa  625  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  35.29 
 
 		 913 aa  438  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  33.97 
 
 		 911 aa  426  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  32.99 
 
 		 896 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  32.45 
 
 		 930 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  28.89 
 
 		 872 aa  350  6e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  28.67 
 
 		 862 aa  345  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.25 
 
 		 906 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.49 
 
 		 916 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  29.22 
 
 		 922 aa  302  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  25.88 
 
 		 858 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  26.39 
 
 		 858 aa  271  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.72 
 
 		 935 aa  264  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  25.44 
 
 		 803 aa  94.4  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  27.47 
 
 		 993 aa  80.1  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  23.5 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  24.29 
 
 		 781 aa  67  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  27.27 
 
 		 864 aa  67.4  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  23.79 
 
 		 786 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  25.96 
 
 		 783 aa  61.2  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.03 
 
 		 908 aa  60.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  28.82 
 
 		 997 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  22.11 
 
 		 911 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1016 aa  60.1  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1000 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  27.43 
 
 		 1000 aa  59.7  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  28.45 
 
 		 991 aa  58.9  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  23.04 
 
 		 991 aa  58.2  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  21.69 
 
 		 951 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  25.59 
 
 		 984 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  27.95 
 
 		 997 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  26.1 
 
 		 988 aa  53.5  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  26.43 
 
 		 991 aa  52  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1039 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.12 
 
 		 958 aa  50.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  34.44 
 
 		 846 aa  50.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  34.11 
 
 		 259 aa  49.7  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  39.06 
 
 		 1044 aa  49.7  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  21.75 
 
 		 969 aa  49.3  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  27.39 
 
 		 1060 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  21.75 
 
 		 969 aa  49.3  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.94 
 
 		 957 aa  48.9  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0871  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1042 aa  48.9  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.124792 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.71 
 
 		 1016 aa  48.5  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  25.15 
 
 		 997 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  25.24 
 
 		 990 aa  48.1  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1052 aa  48.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  25.13 
 
 		 1064 aa  48.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  23.7 
 
 		 919 aa  47.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  25.88 
 
 		 855 aa  48.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1048 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  24.86 
 
 		 1064 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  25.14 
 
 		 1059 aa  46.6  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  26 
 
 		 1052 aa  47  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.65 
 
 		 1048 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.85 
 
 		 1049 aa  47  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  32.53 
 
 		 856 aa  46.2  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  24.8 
 
 		 1052 aa  46.2  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  31.67 
 
 		 1001 aa  45.8  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  22.3 
 
 		 968 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  23.97 
 
 		 977 aa  45.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  23.43 
 
 		 994 aa  44.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  27.53 
 
 		 980 aa  44.3  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>