91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0158 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  49.3 
 
 		 991 aa  746    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  100 
 
 		 991 aa  1877    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  43.85 
 
 		 993 aa  663    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  37.62 
 
 		 1001 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  38.73 
 
 		 1018 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1049 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  34.75 
 
 		 1049 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  34.82 
 
 		 999 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  34.54 
 
 		 1048 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  34.08 
 
 		 1042 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1053 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  33.83 
 
 		 1052 aa  369  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  35.31 
 
 		 1043 aa  369  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1048 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  34.18 
 
 		 1059 aa  366  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  34.4 
 
 		 1052 aa  364  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1042 aa  364  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1052 aa  364  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  34.28 
 
 		 1045 aa  362  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  34.12 
 
 		 1047 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  34.03 
 
 		 1047 aa  355  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  31.57 
 
 		 977 aa  355  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  32.61 
 
 		 1064 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  34.1 
 
 		 1062 aa  351  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  33.3 
 
 		 1064 aa  351  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1049 aa  351  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  33.86 
 
 		 997 aa  349  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  33.86 
 
 		 997 aa  346  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1016 aa  344  4e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  36.99 
 
 		 1015 aa  344  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  29.25 
 
 		 1047 aa  344  5.999999999999999e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  35.49 
 
 		 1014 aa  340  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  31.41 
 
 		 1076 aa  331  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  34.37 
 
 		 1037 aa  328  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  34.73 
 
 		 1040 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  34.43 
 
 		 1054 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  32.74 
 
 		 986 aa  317  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  31.72 
 
 		 988 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  36.62 
 
 		 959 aa  300  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  31.93 
 
 		 980 aa  259  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  36.75 
 
 		 1000 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  21.08 
 
 		 914 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  21.01 
 
 		 911 aa  182  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.54 
 
 		 890 aa  134  9e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  28.52 
 
 		 962 aa  96.3  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  28.5 
 
 		 947 aa  95.5  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  28.01 
 
 		 976 aa  82.8  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  27.34 
 
 		 951 aa  82  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  27.27 
 
 		 864 aa  77.4  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.26 
 
 		 836 aa  75.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  30.3 
 
 		 846 aa  75.5  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.59 
 
 		 957 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  29.11 
 
 		 856 aa  71.6  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  32.2 
 
 		 1106 aa  70.1  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.14 
 
 		 958 aa  70.1  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  29.11 
 
 		 856 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.2 
 
 		 916 aa  69.7  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  22.71 
 
 		 779 aa  66.2  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  21.29 
 
 		 919 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  27.55 
 
 		 855 aa  64.7  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  19.64 
 
 		 911 aa  63.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  24.29 
 
 		 1077 aa  62.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  28.52 
 
 		 883 aa  62.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  26.74 
 
 		 913 aa  62  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  19.59 
 
 		 781 aa  61.2  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  27.94 
 
 		 856 aa  61.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  23.75 
 
 		 951 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.73 
 
 		 940 aa  55.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.46 
 
 		 1113 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  20.96 
 
 		 957 aa  52.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.29 
 
 		 780 aa  52.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1000 aa  51.6  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  25.24 
 
 		 896 aa  51.2  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.91 
 
 		 989 aa  51.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.05 
 
 		 986 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  25.06 
 
 		 911 aa  50.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  25.38 
 
 		 997 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.27 
 
 		 1048 aa  49.7  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  32.05 
 
 		 912 aa  49.7  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  28.92 
 
 		 984 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  28.29 
 
 		 379 aa  48.9  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  29.41 
 
 		 930 aa  48.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.84 
 
 		 1099 aa  48.1  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  26.92 
 
 		 908 aa  48.5  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  48.89 
 
 		 379 aa  47.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  46.67 
 
 		 379 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.25 
 
 		 1043 aa  46.2  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.66 
 
 		 915 aa  46.2  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1100 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  22.69 
 
 		 994 aa  45.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.49 
 
 		 1016 aa  44.7  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>