109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1280 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  100 
 
 		 958 aa  1880    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.08 
 
 		 836 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.29 
 
 		 957 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  31.15 
 
 		 962 aa  239  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  31.79 
 
 		 951 aa  237  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  31.12 
 
 		 947 aa  235  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  33.67 
 
 		 976 aa  233  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.51 
 
 		 915 aa  183  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  26.33 
 
 		 991 aa  179  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  29.78 
 
 		 855 aa  174  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  28.69 
 
 		 856 aa  172  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  29.61 
 
 		 846 aa  162  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  30.62 
 
 		 856 aa  160  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  30.47 
 
 		 856 aa  160  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  29.26 
 
 		 864 aa  153  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  25.07 
 
 		 994 aa  150  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  29.99 
 
 		 883 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  28.5 
 
 		 993 aa  103  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  26.55 
 
 		 1045 aa  102  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  31.88 
 
 		 1037 aa  101  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  26.26 
 
 		 1047 aa  98.2  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  26.1 
 
 		 1047 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  28.22 
 
 		 940 aa  94.7  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  25.95 
 
 		 1043 aa  93.6  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  29 
 
 		 1040 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  23.01 
 
 		 1047 aa  90.5  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  27.97 
 
 		 959 aa  90.9  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.79 
 
 		 1048 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1049 aa  90.1  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  28.77 
 
 		 1054 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  25.12 
 
 		 1052 aa  87.8  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  25 
 
 		 1052 aa  85.9  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  22.09 
 
 		 914 aa  85.5  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  24.83 
 
 		 1052 aa  83.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  25.29 
 
 		 1001 aa  81.3  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1053 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1049 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  27.49 
 
 		 1076 aa  79  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.75 
 
 		 1042 aa  77.4  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  25.04 
 
 		 1059 aa  77  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  25.99 
 
 		 1062 aa  77.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  25.2 
 
 		 1000 aa  73.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.74 
 
 		 803 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  27.38 
 
 		 991 aa  73.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  28.6 
 
 		 991 aa  72.8  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  31.12 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1042 aa  72  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1048 aa  71.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.06 
 
 		 911 aa  69.3  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  26.85 
 
 		 1014 aa  69.7  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  23.43 
 
 		 781 aa  68.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  25.38 
 
 		 999 aa  68.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.13 
 
 		 781 aa  68.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  24.44 
 
 		 1049 aa  68.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  24 
 
 		 988 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.48 
 
 		 1049 aa  65.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  26.33 
 
 		 984 aa  64.7  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  27.17 
 
 		 1015 aa  64.7  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  23.72 
 
 		 977 aa  63.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  29.39 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  20.93 
 
 		 858 aa  62.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  23.65 
 
 		 779 aa  62.8  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  24.03 
 
 		 986 aa  60.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  20.49 
 
 		 858 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  22.47 
 
 		 783 aa  60.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  25.85 
 
 		 1064 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  22.97 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  22.97 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  22.97 
 
 		 788 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.73 
 
 		 1048 aa  57.4  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  23.71 
 
 		 780 aa  55.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  21.52 
 
 		 911 aa  54.7  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  29.9 
 
 		 333 aa  54.7  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.82 
 
 		 916 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  33.33 
 
 		 294 aa  54.3  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  29.55 
 
 		 280 aa  53.5  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  23.52 
 
 		 896 aa  53.5  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  32.99 
 
 		 278 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  26.83 
 
 		 990 aa  52.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  29.06 
 
 		 334 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1100 aa  51.6  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  22.42 
 
 		 997 aa  51.6  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1016 aa  51.6  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27.9 
 
 		 1045 aa  51.6  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  32.83 
 
 		 304 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  26.54 
 
 		 997 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  26.54 
 
 		 997 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.61 
 
 		 908 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.75 
 
 		 989 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.01 
 
 		 968 aa  49.3  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  27.92 
 
 		 323 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  27.12 
 
 		 912 aa  48.9  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  25.18 
 
 		 865 aa  48.9  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 1052 aa  48.9  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  29.02 
 
 		 295 aa  48.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  30.73 
 
 		 303 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  30.61 
 
 		 277 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  30.61 
 
 		 277 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  30.61 
 
 		 277 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  20.06 
 
 		 951 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>