76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2634 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  100 
 
 		 303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  78.49 
 
 		 334 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  61.96 
 
 		 286 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  61.98 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  54.93 
 
 		 311 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  55.33 
 
 		 299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  58.4 
 
 		 351 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  61.33 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  58.02 
 
 		 294 aa  295  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  54.74 
 
 		 333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  54.95 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  54.04 
 
 		 284 aa  282  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  57.95 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  51.55 
 
 		 297 aa  272  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  52.43 
 
 		 273 aa  271  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  54.05 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  51.32 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  53.7 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  56.77 
 
 		 303 aa  265  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  53.05 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  52.26 
 
 		 266 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  53.7 
 
 		 278 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  52.27 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  54.37 
 
 		 277 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  54.37 
 
 		 277 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  54.37 
 
 		 277 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  49.81 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  50.54 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  50.39 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  43.13 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  36.61 
 
 		 259 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  31.05 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  28.43 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  34.2 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  29.97 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  28.46 
 
 		 543 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.31 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.81 
 
 		 1019 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  23.91 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  31.37 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  31.09 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  25 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.75 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  29.67 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  29.37 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  28.67 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  29.02 
 
 		 387 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  29.02 
 
 		 387 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.25 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  26.32 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  28.62 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 1066 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  27.62 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  29 
 
 		 1038 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  32.92 
 
 		 1048 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28.68 
 
 		 1052 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  23.94 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 		 1038 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 		 1016 aa  50.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  25.65 
 
 		 263 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  25.66 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.73 
 
 		 958 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  23.27 
 
 		 780 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  24.29 
 
 		 783 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1715  hypothetical protein  29.18 
 
 		 860 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  26.76 
 
 		 1045 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0781  hypothetical protein  41.33 
 
 		 886 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384751  normal  0.165581 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1578  hypothetical protein  33.87 
 
 		 753 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  31.41 
 
 		 1051 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  31.41 
 
 		 1051 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1291  hypothetical protein  20.28 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  28.19 
 
 		 984 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  32.05 
 
 		 1051 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  30.36 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>