84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2353 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  591  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  91.75 
 
 		 322 aa  524  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  60 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  57.3 
 
 		 351 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  63.22 
 
 		 286 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  60.28 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  58.46 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  58.62 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  57.69 
 
 		 299 aa  308  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  59.92 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  59.92 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  59.92 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  59 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  58.02 
 
 		 291 aa  300  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  57.63 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  56.98 
 
 		 267 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  54.51 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  57.47 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  56.77 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  52.41 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  55.56 
 
 		 266 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  56.82 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  54.51 
 
 		 302 aa  272  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  52.96 
 
 		 273 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  50.79 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  51.98 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  54.18 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  52.26 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  50.55 
 
 		 280 aa  256  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  45.1 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  39.68 
 
 		 259 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  28.29 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 1019 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  29.28 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  28.88 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  24.61 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  32.48 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  30.19 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  25.36 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  30.48 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 1052 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  28.11 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  30.68 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.84 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  28.79 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  29.93 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  26.18 
 
 		 615 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1310  hypothetical protein  19.55 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.251322  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  26.22 
 
 		 543 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  22.79 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  26.16 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  29.84 
 
 		 387 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  28.77 
 
 		 1106 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  24.36 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  26.57 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  29.07 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  29.63 
 
 		 1076 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  29.01 
 
 		 1051 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  29.01 
 
 		 1051 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  22.73 
 
 		 276 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  29.01 
 
 		 1051 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  29.07 
 
 		 387 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.99 
 
 		 1016 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 1048 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  29.01 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1061 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  29.01 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.26 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  29.01 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  30.73 
 
 		 1164 aa  46.2  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  33.14 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  30.54 
 
 		 962 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  34.92 
 
 		 1038 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1057 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  25.57 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 1038 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1737  phage NTP-binding protein  22.45 
 
 		 530 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  28.57 
 
 		 951 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 1099 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  30.11 
 
 		 1094 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  30.3 
 
 		 988 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  25.91 
 
 		 781 aa  43.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  28.08 
 
 		 947 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.16 
 
 		 401 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>