119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1816 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  67.7 
 
 		 273 aa  362  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  59.3 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  54.18 
 
 		 295 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  54.02 
 
 		 297 aa  298  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  58.53 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  54.37 
 
 		 299 aa  291  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  56.06 
 
 		 284 aa  291  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  52.75 
 
 		 351 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  53.53 
 
 		 294 aa  288  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  54.95 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  56.25 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  49.32 
 
 		 313 aa  271  7e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  51.39 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  51.74 
 
 		 333 aa  268  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  51.33 
 
 		 297 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  51.14 
 
 		 334 aa  261  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  51.53 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  52.59 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  51.85 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  51.85 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  51.85 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  51.14 
 
 		 291 aa  254  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  48.24 
 
 		 267 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  51.15 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  51.14 
 
 		 278 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  48.47 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  48.11 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  49.08 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  45.78 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  35.46 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 1019 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  28.94 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  31.48 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  26.67 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  26.86 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  24.18 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  27.33 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  28.67 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  26.59 
 
 		 615 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 1016 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  31.05 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.18 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  31.47 
 
 		 1052 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  29.91 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  27.53 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  26.39 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  33.1 
 
 		 1064 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  22.07 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  20.8 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  27.97 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  25.76 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  23.4 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  25.66 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  28.52 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  25.41 
 
 		 543 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  28.02 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.54 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  28.4 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  28.4 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  27.95 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  33.33 
 
 		 1064 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.36 
 
 		 379 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.94 
 
 		 958 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 		 1066 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.14 
 
 		 379 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.3 
 
 		 1124 aa  52.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.58 
 
 		 1042 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0229  hypothetical protein  22.02 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  26.42 
 
 		 780 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  27.14 
 
 		 864 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  26.92 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  27.21 
 
 		 1055 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  23.08 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.35 
 
 		 781 aa  49.3  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 1048 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 1164 aa  48.9  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 1135 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 1038 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  26.98 
 
 		 855 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 1038 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  26.17 
 
 		 988 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1052 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  30.15 
 
 		 1052 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  33.92 
 
 		 991 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 1051 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 1051 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 1051 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  23.72 
 
 		 783 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.41 
 
 		 968 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  22.77 
 
 		 788 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  28.89 
 
 		 1052 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  22.3 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 		 970 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  27.97 
 
 		 1059 aa  46.6  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  29.41 
 
 		 986 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  27.62 
 
 		 1000 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1535  hypothetical protein  20.09 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  22.77 
 
 		 788 aa  45.8  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  27.27 
 
 		 997 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>