More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13225 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  44.05 
 
 		 1094 aa  642    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.03 
 
 		 1066 aa  724    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 1055 aa  2052    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  65.28 
 
 		 1051 aa  1212    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  46.29 
 
 		 1129 aa  739    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  62.25 
 
 		 1038 aa  1160    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  46.48 
 
 		 1050 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  65.28 
 
 		 1051 aa  1212    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  63.89 
 
 		 1038 aa  1195    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  65.21 
 
 		 1051 aa  1204    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  39.6 
 
 		 1060 aa  561  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  39.14 
 
 		 1044 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.91 
 
 		 1051 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  40.58 
 
 		 1062 aa  525  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  38.93 
 
 		 1144 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  39.08 
 
 		 1059 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  38.37 
 
 		 1040 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  39.74 
 
 		 1096 aa  502  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  38.26 
 
 		 1074 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  36.99 
 
 		 1095 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  38.52 
 
 		 1099 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  33.13 
 
 		 1134 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.11 
 
 		 1124 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  34.94 
 
 		 1115 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  36.65 
 
 		 1098 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  37.24 
 
 		 1076 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  35.19 
 
 		 1103 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  30.66 
 
 		 1059 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  34.31 
 
 		 1060 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.15 
 
 		 1145 aa  382  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  33.57 
 
 		 1150 aa  362  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.36 
 
 		 1083 aa  355  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  34.59 
 
 		 1085 aa  317  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.81 
 
 		 1058 aa  285  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  33.78 
 
 		 1135 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  38.64 
 
 		 1197 aa  159  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  20.82 
 
 		 666 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.83 
 
 		 729 aa  115  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 		 817 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.12 
 
 		 1019 aa  112  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 798 aa  112  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 		 1052 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.78 
 
 		 662 aa  108  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 		 804 aa  107  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.51 
 
 		 730 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.35 
 
 		 765 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  23.5 
 
 		 736 aa  105  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 1162 aa  105  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.56 
 
 		 755 aa  104  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  24.86 
 
 		 795 aa  104  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.96 
 
 		 892 aa  104  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.35 
 
 		 715 aa  103  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  18.82 
 
 		 1016 aa  102  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  24.55 
 
 		 797 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 1073 aa  102  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 790 aa  102  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.79 
 
 		 737 aa  102  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  29.09 
 
 		 1101 aa  101  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  24.76 
 
 		 795 aa  101  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  20.79 
 
 		 678 aa  101  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 1041 aa  100  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 665 aa  99  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  21.35 
 
 		 685 aa  97.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 1048 aa  97.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  22.27 
 
 		 680 aa  96.3  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.66 
 
 		 814 aa  97.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.27 
 
 		 725 aa  97.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  22.54 
 
 		 688 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  22.11 
 
 		 816 aa  95.5  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.6 
 
 		 730 aa  95.5  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  20.79 
 
 		 678 aa  95.5  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.6 
 
 		 730 aa  95.5  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  20.72 
 
 		 807 aa  95.5  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  19.58 
 
 		 735 aa  95.1  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  19.92 
 
 		 745 aa  94.7  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  22.36 
 
 		 1066 aa  94.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  20.46 
 
 		 757 aa  94.4  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.06 
 
 		 729 aa  94.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  19.83 
 
 		 638 aa  94  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.07 
 
 		 759 aa  94.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  21.13 
 
 		 678 aa  94  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 		 770 aa  94.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 718 aa  94.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  22.69 
 
 		 799 aa  94.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  21.84 
 
 		 772 aa  93.6  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.26 
 
 		 763 aa  93.6  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.31 
 
 		 1023 aa  93.6  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.57 
 
 		 672 aa  93.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 825 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  25.46 
 
 		 816 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  20.06 
 
 		 749 aa  93.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  20.52 
 
 		 946 aa  92.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  20.68 
 
 		 696 aa  92.4  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  20.52 
 
 		 946 aa  92.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  29.13 
 
 		 1103 aa  91.3  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  19.74 
 
 		 724 aa  90.9  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 743 aa  90.9  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  25.11 
 
 		 789 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  23.42 
 
 		 726 aa  90.1  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  21.2 
 
 		 723 aa  90.1  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>