More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4666 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  45.39 
 
 		 1129 aa  728    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  70.29 
 
 		 1051 aa  1343    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.46 
 
 		 1066 aa  730    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  45.77 
 
 		 1094 aa  684    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  62.73 
 
 		 1055 aa  1186    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  70.29 
 
 		 1051 aa  1343    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  82.3 
 
 		 1038 aa  1638    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  70 
 
 		 1051 aa  1333    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1038 aa  2019    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  46.7 
 
 		 1050 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.92 
 
 		 1051 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  37.69 
 
 		 1044 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  38.79 
 
 		 1059 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  37.42 
 
 		 1060 aa  516  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  38.94 
 
 		 1144 aa  516  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  39.27 
 
 		 1062 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  40.67 
 
 		 1096 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  38.12 
 
 		 1095 aa  491  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  37.34 
 
 		 1074 aa  492  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  36.82 
 
 		 1040 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  34.02 
 
 		 1134 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  37.14 
 
 		 1099 aa  442  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  36.94 
 
 		 1076 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.12 
 
 		 1124 aa  402  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  34.51 
 
 		 1135 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  35.38 
 
 		 1103 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.75 
 
 		 1145 aa  364  5.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  30.22 
 
 		 1059 aa  356  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  33.14 
 
 		 1115 aa  348  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  35.2 
 
 		 1085 aa  333  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.39 
 
 		 1083 aa  332  3e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  32.04 
 
 		 1150 aa  300  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.24 
 
 		 1058 aa  291  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  39.96 
 
 		 1098 aa  261  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  37.01 
 
 		 1060 aa  189  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  38.38 
 
 		 1197 aa  172  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.29 
 
 		 729 aa  123  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.34 
 
 		 730 aa  109  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  22.86 
 
 		 1019 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  20.72 
 
 		 946 aa  101  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  20.72 
 
 		 946 aa  101  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  18.99 
 
 		 722 aa  99  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 1177 aa  99  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  22.23 
 
 		 1066 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 1180 aa  95.5  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.48 
 
 		 715 aa  93.6  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 1041 aa  92.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  26.39 
 
 		 1103 aa  92  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.37 
 
 		 737 aa  89.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  18.03 
 
 		 666 aa  89  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  23.39 
 
 		 668 aa  88.2  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  23.68 
 
 		 680 aa  88.2  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.05 
 
 		 725 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.95 
 
 		 755 aa  87  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  21.34 
 
 		 1041 aa  87  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  18.99 
 
 		 723 aa  86.3  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  20.69 
 
 		 749 aa  86.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.38 
 
 		 772 aa  86.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  22.36 
 
 		 743 aa  82.8  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 		 826 aa  82.8  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.39 
 
 		 1023 aa  82.4  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 		 804 aa  82.4  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  19.37 
 
 		 724 aa  82  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  24.28 
 
 		 768 aa  82  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  23.56 
 
 		 825 aa  81.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  22.22 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 1073 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.18 
 
 		 741 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  20.03 
 
 		 765 aa  79.3  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  22.16 
 
 		 900 aa  79.7  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 		 753 aa  79.3  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  20.61 
 
 		 678 aa  79  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  25.97 
 
 		 707 aa  79  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.75 
 
 		 762 aa  79  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  23.67 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.97 
 
 		 730 aa  78.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.97 
 
 		 730 aa  78.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  18.63 
 
 		 659 aa  78.2  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  19.65 
 
 		 714 aa  76.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  19.24 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.38 
 
 		 673 aa  77  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.38 
 
 		 673 aa  77  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.38 
 
 		 673 aa  77  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  27.31 
 
 		 1111 aa  76.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  23.78 
 
 		 736 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  19.24 
 
 		 677 aa  75.9  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.56 
 
 		 751 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  19.4 
 
 		 696 aa  75.5  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  20.72 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  20.08 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.11 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.56 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.45 
 
 		 729 aa  73.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  22.91 
 
 		 728 aa  73.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.37 
 
 		 892 aa  73.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 816 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  20 
 
 		 769 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  23.95 
 
 		 817 aa  73.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  22.8 
 
 		 730 aa  73.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  20.95 
 
 		 787 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>