110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2636 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  64.18 
 
 		 295 aa  353  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  65.56 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  61.65 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  62.31 
 
 		 351 aa  339  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  57.61 
 
 		 313 aa  335  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  61.39 
 
 		 294 aa  320  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  58.85 
 
 		 333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  62.6 
 
 		 297 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  55.33 
 
 		 303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  59.42 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  56.98 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  57.2 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  56.34 
 
 		 320 aa  298  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  58.08 
 
 		 266 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  55.72 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  57.31 
 
 		 303 aa  295  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  54.37 
 
 		 280 aa  291  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  55.13 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  55.13 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  55.13 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  55.98 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  52.36 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  53.16 
 
 		 291 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  53.49 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  54.02 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  54.33 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  52.85 
 
 		 278 aa  271  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  51.79 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  45.74 
 
 		 298 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  34.24 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.35 
 
 		 1019 aa  99  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  27.68 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  31.68 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  27.41 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  31.72 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  27.86 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  28.01 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  28.95 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  25.19 
 
 		 615 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  23.26 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  27.47 
 
 		 543 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  25.56 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 1016 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  27.24 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  27.31 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  28.36 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 1052 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  21.9 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  27.08 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  26.32 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  29.47 
 
 		 960 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  24.71 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1061 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  33.14 
 
 		 997 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  26.24 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  31.11 
 
 		 1038 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.53 
 
 		 379 aa  52.8  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  30.16 
 
 		 1038 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  32.57 
 
 		 997 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  31.12 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  24.05 
 
 		 1055 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  26.39 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  29.17 
 
 		 986 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  27.44 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  26.04 
 
 		 387 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  29.96 
 
 		 855 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  24.51 
 
 		 379 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  25.94 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  25.94 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 		 1051 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 		 1051 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  19.7 
 
 		 803 aa  48.9  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  25.28 
 
 		 387 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  24.25 
 
 		 780 aa  49.3  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 		 1051 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  24.12 
 
 		 783 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 1094 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  28.4 
 
 		 1106 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.75 
 
 		 988 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.46 
 
 		 1048 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0229  hypothetical protein  23.05 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  20.83 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  33.08 
 
 		 1064 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1429  hypothetical protein  22.01 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.99 
 
 		 1124 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  26.16 
 
 		 1045 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  29.79 
 
 		 1054 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  31.93 
 
 		 1064 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.21 
 
 		 1183 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  27.45 
 
 		 1000 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  31.36 
 
 		 991 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1291  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1265  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.34 
 
 		 915 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1299  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0504413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1535  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3915  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1263  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.217643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  31.1 
 
 		 977 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>