72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1068 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  844    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  30.18 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  29.15 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  28.21 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  24.73 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  25.56 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  25.56 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  25.56 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  25.1 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.89 
 
 		 1019 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  24.34 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 1052 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  23.9 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  24.44 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  25.74 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  24.46 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  22.89 
 
 		 297 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  24.18 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  22.38 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  23.91 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  24.24 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  24.72 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 		 1016 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  24.81 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  23.17 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  21.25 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  22.86 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  23.39 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  23.18 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  24.07 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  25.36 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  21.97 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  25.1 
 
 		 244 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  21.53 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  20.96 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  25.87 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  22.71 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  21.9 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  21.24 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  23.86 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  23.51 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  22.05 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  25.48 
 
 		 781 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  23.05 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  21.68 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  20.82 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  21.64 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  30.19 
 
 		 1048 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  24.25 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  19.52 
 
 		 306 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  23.56 
 
 		 287 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  24.24 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  20.83 
 
 		 259 aa  53.1  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  25.77 
 
 		 783 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  21.8 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  22.73 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  23.11 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  23.02 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  23.02 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2313  UvrD/REP helicase  22.18 
 
 		 984 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  22.74 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  20.07 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  20.15 
 
 		 921 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  22.34 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  24.34 
 
 		 1134 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  24.78 
 
 		 865 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  22.51 
 
 		 1066 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  24.49 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  21.88 
 
 		 970 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.87 
 
 		 1140 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  41.46 
 
 		 991 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>