70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  100 
 
 		 313 aa  621  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  57.61 
 
 		 299 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  57.63 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  55.14 
 
 		 286 aa  295  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  54.36 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  55.63 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  52.07 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  49.02 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  49.83 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  49.32 
 
 		 280 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  50.66 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  51.32 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  51.01 
 
 		 284 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  54.23 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  49.49 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  52.07 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  51.22 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  50.69 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  48.47 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  50.7 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  47.57 
 
 		 267 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  48.46 
 
 		 277 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  48.46 
 
 		 277 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  48.46 
 
 		 277 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  47.1 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  48.46 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  47.44 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  44.37 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  44.48 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  44.44 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  34.27 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.11 
 
 		 1019 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  27.78 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  28.3 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  27.74 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  26.71 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  30.24 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  28.06 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  25.86 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  30.1 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  22.03 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  25.73 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  22.95 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  26.05 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  21.68 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  20.98 
 
 		 1016 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  27.61 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  25.4 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.33 
 
 		 1124 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  28.32 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 1052 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  26.25 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  27.55 
 
 		 387 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  24.39 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1737  phage NTP-binding protein  27.15 
 
 		 530 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 1059 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  26.67 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  32.82 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.46 
 
 		 986 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  36.89 
 
 		 1101 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0229  hypothetical protein  20.72 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  27.93 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  24.48 
 
 		 781 aa  44.3  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  28.03 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.93 
 
 		 387 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.93 
 
 		 387 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  36.92 
 
 		 1051 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  36.92 
 
 		 1051 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  30.91 
 
 		 1076 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  24.15 
 
 		 951 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>