58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2601 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  44.03 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  24.7 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  27.67 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 1019 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  25.56 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.15 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  27.17 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  31.68 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  23.51 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  24.22 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  25.2 
 
 		 1052 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  26.75 
 
 		 783 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  21.97 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  22.73 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  23.4 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  25.27 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  24.53 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  28.67 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  26.57 
 
 		 780 aa  55.5  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  26.34 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  23.05 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  23.05 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  23.05 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.54 
 
 		 1016 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  28.25 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  29.22 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 1134 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  22.76 
 
 		 803 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  24.36 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1482  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 911 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0495505  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  26.25 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  21.8 
 
 		 411 aa  49.3  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  25.65 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  23.77 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 1060 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 1060 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  23.76 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  27.4 
 
 		 1059 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  23.97 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  21.03 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  24.23 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  27.35 
 
 		 320 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.3 
 
 		 1083 aa  45.4  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  26.89 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1358  DNA helicase II  24.5 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.248341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  23.32 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  28.39 
 
 		 1066 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  25.69 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  23.14 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  23.13 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 1135 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  24.34 
 
 		 1076 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  22.52 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  26.23 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1737  phage NTP-binding protein  22.68 
 
 		 530 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1310  hypothetical protein  19.38 
 
 		 247 aa  42  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.251322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>