More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2474 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  54 
 
 		 1124 aa  916    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  56.69 
 
 		 1197 aa  684    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  42.49 
 
 		 1059 aa  718    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  48.37 
 
 		 1085 aa  668    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1076 aa  2008    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  47.16 
 
 		 1098 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  41.65 
 
 		 1115 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.5 
 
 		 1066 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  42.55 
 
 		 1144 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  39.29 
 
 		 1044 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  41.76 
 
 		 1050 aa  535  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  40.17 
 
 		 1059 aa  535  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  40.4 
 
 		 1150 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  43.63 
 
 		 1096 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.58 
 
 		 1051 aa  505  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  39.67 
 
 		 1060 aa  505  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  42.1 
 
 		 1062 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  40.64 
 
 		 1095 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.24 
 
 		 1083 aa  484  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  38.69 
 
 		 1040 aa  479  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  38.78 
 
 		 1074 aa  473  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.9 
 
 		 1145 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  37.93 
 
 		 1038 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  37.56 
 
 		 1055 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  38.04 
 
 		 1129 aa  436  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  37.64 
 
 		 1094 aa  435  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  37.33 
 
 		 1038 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  37.65 
 
 		 1051 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  37.65 
 
 		 1051 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.17 
 
 		 1058 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  37.63 
 
 		 1051 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  34.97 
 
 		 1134 aa  426  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  36.23 
 
 		 1060 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  37.32 
 
 		 1099 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  37.71 
 
 		 1103 aa  369  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  35.68 
 
 		 1135 aa  366  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.88 
 
 		 743 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  21.56 
 
 		 757 aa  106  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.92 
 
 		 729 aa  105  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.15 
 
 		 755 aa  103  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  28.19 
 
 		 1428 aa  102  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 688 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 706 aa  102  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.43 
 
 		 715 aa  102  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  19.69 
 
 		 625 aa  101  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  18.79 
 
 		 666 aa  101  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  25.24 
 
 		 741 aa  100  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.52 
 
 		 785 aa  100  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  20.51 
 
 		 681 aa  99.4  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.9 
 
 		 694 aa  99.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  18.12 
 
 		 731 aa  99  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.6 
 
 		 833 aa  98.2  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  20.73 
 
 		 789 aa  97.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  22.28 
 
 		 668 aa  97.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1154  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1528 aa  95.9  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.09 
 
 		 858 aa  95.1  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  24.19 
 
 		 705 aa  93.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.46 
 
 		 1023 aa  92.4  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 706 aa  92.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.61 
 
 		 797 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.89 
 
 		 751 aa  91.7  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  19.97 
 
 		 682 aa  89.7  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  20.86 
 
 		 764 aa  90.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.89 
 
 		 751 aa  90.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 762 aa  89.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  23.85 
 
 		 734 aa  88.6  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  17.06 
 
 		 722 aa  88.6  6e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  20.79 
 
 		 772 aa  88.6  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.94 
 
 		 741 aa  88.2  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.3 
 
 		 738 aa  87.4  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.11 
 
 		 763 aa  87.4  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  24.25 
 
 		 790 aa  87.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  28.66 
 
 		 712 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  27.25 
 
 		 1124 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  21.39 
 
 		 786 aa  86.7  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.85 
 
 		 765 aa  87  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  20.74 
 
 		 742 aa  86.3  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  23.91 
 
 		 768 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  22.7 
 
 		 900 aa  85.9  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  19.81 
 
 		 723 aa  85.1  0.000000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 738 aa  85.1  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  20.42 
 
 		 745 aa  84.7  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 620 aa  84.7  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 726 aa  84.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  21.37 
 
 		 946 aa  84  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  23.05 
 
 		 717 aa  84.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  20.09 
 
 		 714 aa  84.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  21.37 
 
 		 946 aa  84  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.54 
 
 		 802 aa  84  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.42 
 
 		 753 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  23.23 
 
 		 812 aa  83.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.59 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.42 
 
 		 753 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.48 
 
 		 747 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.6 
 
 		 741 aa  83.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.55 
 
 		 751 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  23.16 
 
 		 762 aa  82.4  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.48 
 
 		 747 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  21.55 
 
 		 753 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  21.48 
 
 		 751 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>