More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2902 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.56 
 
 		 1124 aa  804    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  48.09 
 
 		 1076 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1085 aa  2062    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  38.66 
 
 		 1059 aa  615  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  48.95 
 
 		 1197 aa  599  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  43.16 
 
 		 1098 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  38.61 
 
 		 1115 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  37.82 
 
 		 1059 aa  489  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  40.41 
 
 		 1144 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  39.12 
 
 		 1050 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  39.41 
 
 		 1095 aa  479  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  37.23 
 
 		 1150 aa  472  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  40.77 
 
 		 1096 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.39 
 
 		 1066 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.64 
 
 		 1051 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  36.37 
 
 		 1044 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.16 
 
 		 1083 aa  440  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  37.75 
 
 		 1074 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  36.46 
 
 		 1040 aa  435  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.4 
 
 		 1145 aa  428  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  39.19 
 
 		 1062 aa  429  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  36.23 
 
 		 1060 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  35.02 
 
 		 1055 aa  399  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  36.4 
 
 		 1129 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  36.23 
 
 		 1038 aa  396  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.78 
 
 		 1058 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  35.13 
 
 		 1051 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  35.13 
 
 		 1051 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  35.17 
 
 		 1038 aa  389  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  35.39 
 
 		 1051 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  36.39 
 
 		 1094 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  31.72 
 
 		 1134 aa  350  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  34.98 
 
 		 1099 aa  344  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  34.73 
 
 		 1060 aa  334  7.000000000000001e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  33.92 
 
 		 1135 aa  323  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  34.67 
 
 		 1103 aa  314  4.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1154  hypothetical protein  25 
 
 		 1528 aa  105  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193707 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  34.27 
 
 		 1428 aa  89.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  18.75 
 
 		 731 aa  89  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  25.92 
 
 		 1124 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  28.9 
 
 		 1162 aa  81.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.25 
 
 		 713 aa  79  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 1144 aa  79  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 1041 aa  77.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  22.98 
 
 		 717 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  19.29 
 
 		 666 aa  73.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  25.1 
 
 		 1244 aa  74.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.74 
 
 		 726 aa  74.3  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  23.96 
 
 		 816 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.82 
 
 		 725 aa  71.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.03 
 
 		 768 aa  69.3  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  31.3 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 		 768 aa  68.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.89 
 
 		 785 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  21.84 
 
 		 668 aa  67.8  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 1124 aa  67  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.62 
 
 		 715 aa  67  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  20.09 
 
 		 706 aa  67  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  21.62 
 
 		 648 aa  67.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  21.62 
 
 		 648 aa  67.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  25.82 
 
 		 1073 aa  65.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 		 668 aa  65.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  22.71 
 
 		 798 aa  65.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  29.43 
 
 		 1143 aa  65.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.6 
 
 		 729 aa  65.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  19.89 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.18 
 
 		 742 aa  64.7  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  27.48 
 
 		 1108 aa  64.7  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  29.23 
 
 		 1120 aa  64.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.45 
 
 		 788 aa  64.3  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  23.56 
 
 		 706 aa  63.9  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.21 
 
 		 755 aa  64.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 1128 aa  64.3  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.24 
 
 		 738 aa  63.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  27.15 
 
 		 1101 aa  63.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 762 aa  63.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.19 
 
 		 718 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  18.02 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.04 
 
 		 765 aa  62.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 858 aa  62.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.39 
 
 		 817 aa  62.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  22.56 
 
 		 668 aa  62.4  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  21.46 
 
 		 722 aa  62  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.6 
 
 		 802 aa  62.4  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  21.46 
 
 		 722 aa  62  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  21.46 
 
 		 722 aa  62  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  21.1 
 
 		 738 aa  62.4  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  21.56 
 
 		 722 aa  62  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  20.69 
 
 		 738 aa  62  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  21.56 
 
 		 722 aa  62  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  22.83 
 
 		 795 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  21.69 
 
 		 741 aa  62  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  21.31 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  22.73 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  21.27 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  21.44 
 
 		 722 aa  60.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  22.92 
 
 		 760 aa  61.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>