44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0955 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  100 
 
 		 1428 aa  2893    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1154  hypothetical protein  38.02 
 
 		 1528 aa  927    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  31.5 
 
 		 1197 aa  112  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  31.97 
 
 		 1059 aa  110  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  30.47 
 
 		 1098 aa  107  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  29.7 
 
 		 1115 aa  100  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  30.5 
 
 		 1076 aa  97.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.03 
 
 		 1066 aa  95.1  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.86 
 
 		 1083 aa  91.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.52 
 
 		 1124 aa  90.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  36.04 
 
 		 1150 aa  88.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.99 
 
 		 1058 aa  87.8  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  27.58 
 
 		 1038 aa  85.5  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  32.07 
 
 		 1074 aa  84  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.98 
 
 		 1145 aa  82  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.34 
 
 		 1051 aa  81.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 1085 aa  81.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 1059 aa  81.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 1094 aa  77  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 		 1095 aa  76.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  25.23 
 
 		 1044 aa  75.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 1060 aa  74.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1038 aa  74.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 1134 aa  73.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  32.34 
 
 		 1144 aa  72.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  31.84 
 
 		 1096 aa  72.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 		 1040 aa  69.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  32.2 
 
 		 1050 aa  68.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  31.52 
 
 		 1129 aa  65.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  24.62 
 
 		 1055 aa  65.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  29.44 
 
 		 1060 aa  64.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  32.74 
 
 		 1062 aa  60.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  29.32 
 
 		 1051 aa  58.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  31.63 
 
 		 1103 aa  56.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  28.65 
 
 		 1135 aa  55.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  22.79 
 
 		 1099 aa  55.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3271  UvrD/REP helicase  45.28 
 
 		 607 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 685 aa  47.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  25.13 
 
 		 741 aa  48.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  29.51 
 
 		 706 aa  47.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  25.12 
 
 		 1073 aa  46.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  27.35 
 
 		 520 aa  45.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>