More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2757 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.55 
 
 		 1145 aa  715    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1150 aa  2266    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  75.91 
 
 		 1115 aa  1628    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  41.72 
 
 		 1098 aa  586  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.97 
 
 		 1124 aa  582  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  40.07 
 
 		 1076 aa  535  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  37.27 
 
 		 1144 aa  516  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  37.29 
 
 		 1095 aa  516  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  36.67 
 
 		 1197 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  38.19 
 
 		 1096 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  37.35 
 
 		 1062 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.1 
 
 		 1051 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.62 
 
 		 1066 aa  489  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  36.31 
 
 		 1044 aa  485  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  36.84 
 
 		 1050 aa  486  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  33.83 
 
 		 1059 aa  482  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  36.23 
 
 		 1060 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  36.17 
 
 		 1059 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  35.32 
 
 		 1040 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  36.48 
 
 		 1074 aa  473  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  36.59 
 
 		 1085 aa  422  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  33.3 
 
 		 1129 aa  409  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.33 
 
 		 1083 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  34.17 
 
 		 1055 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  32.02 
 
 		 1134 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  34.74 
 
 		 1060 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  33.54 
 
 		 1094 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  34.7 
 
 		 1038 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  33.61 
 
 		 1051 aa  362  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  33.61 
 
 		 1051 aa  362  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  33.67 
 
 		 1051 aa  359  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  33.94 
 
 		 1103 aa  338  5e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  33.15 
 
 		 1038 aa  337  9e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.09 
 
 		 1058 aa  300  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  30.6 
 
 		 1099 aa  294  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  33.07 
 
 		 1135 aa  212  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  23.06 
 
 		 946 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  23.06 
 
 		 946 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  36.04 
 
 		 1428 aa  98.2  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  23.7 
 
 		 721 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1154  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1528 aa  92.8  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  23.73 
 
 		 721 aa  92.4  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.22 
 
 		 785 aa  92.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  22.99 
 
 		 757 aa  91.3  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  24.83 
 
 		 706 aa  90.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 		 817 aa  87.4  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  24.22 
 
 		 707 aa  84.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.46 
 
 		 725 aa  83.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.54 
 
 		 715 aa  82.8  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.62 
 
 		 831 aa  82.8  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 688 aa  82.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.52 
 
 		 672 aa  82  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.22 
 
 		 739 aa  81.6  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  20.54 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.58 
 
 		 745 aa  79.7  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 741 aa  79.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.43 
 
 		 662 aa  77.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.83 
 
 		 742 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  22.86 
 
 		 728 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  22.41 
 
 		 723 aa  77.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  24.82 
 
 		 804 aa  76.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 726 aa  75.5  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.77 
 
 		 1032 aa  75.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  25.3 
 
 		 1232 aa  74.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.31 
 
 		 802 aa  73.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  20.76 
 
 		 765 aa  73.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.56 
 
 		 718 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.27 
 
 		 694 aa  73.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  25 
 
 		 709 aa  73.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  22.56 
 
 		 744 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 709 aa  73.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  24.18 
 
 		 799 aa  73.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.15 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  20.08 
 
 		 722 aa  72.8  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  21.64 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.31 
 
 		 1019 aa  72.4  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  21.66 
 
 		 666 aa  72.4  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  26.98 
 
 		 770 aa  71.6  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.1 
 
 		 858 aa  71.6  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2179  UvrD/REP helicase  25.49 
 
 		 809 aa  71.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.577747  normal  0.847748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 		 1180 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  20.97 
 
 		 678 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.92 
 
 		 732 aa  71.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  22.37 
 
 		 723 aa  70.1  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  23.07 
 
 		 736 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  19.28 
 
 		 723 aa  70.1  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  22.37 
 
 		 723 aa  69.7  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.27 
 
 		 814 aa  69.3  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  23.68 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  20.25 
 
 		 684 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.99 
 
 		 658 aa  68.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  21.7 
 
 		 696 aa  68.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 1162 aa  68.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.18 
 
 		 794 aa  68.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 		 1082 aa  68.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.53 
 
 		 773 aa  68.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  23.81 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.19 
 
 		 817 aa  67.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  24.25 
 
 		 816 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.06 
 
 		 858 aa  67.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>