More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4131 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  49.18 
 
 		 1059 aa  802    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  50.14 
 
 		 1062 aa  780    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  48.02 
 
 		 1044 aa  819    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  48.69 
 
 		 1074 aa  768    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1096 aa  2089    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.61 
 
 		 1066 aa  735    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.96 
 
 		 1051 aa  800    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  45.76 
 
 		 1050 aa  705    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  92.08 
 
 		 1144 aa  1841    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  49.72 
 
 		 1040 aa  837    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  48.84 
 
 		 1060 aa  828    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  40.33 
 
 		 1134 aa  616  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  41.44 
 
 		 1129 aa  565  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  40.54 
 
 		 1060 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  44.94 
 
 		 1098 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  43.66 
 
 		 1076 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  41.11 
 
 		 1038 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  39.93 
 
 		 1055 aa  555  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  40.85 
 
 		 1038 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.38 
 
 		 1124 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  39.47 
 
 		 1135 aa  546  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  42.17 
 
 		 1103 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  39.86 
 
 		 1115 aa  538  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  40.34 
 
 		 1051 aa  523  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  41.03 
 
 		 1099 aa  522  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  40.34 
 
 		 1051 aa  523  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  40.44 
 
 		 1051 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  39.4 
 
 		 1094 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  38.88 
 
 		 1150 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  47.24 
 
 		 1095 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  35.29 
 
 		 1059 aa  449  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.87 
 
 		 1145 aa  447  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  41.21 
 
 		 1085 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.07 
 
 		 1083 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.58 
 
 		 1058 aa  315  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  46.38 
 
 		 1197 aa  247  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 724 aa  170  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.1 
 
 		 718 aa  168  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.6 
 
 		 729 aa  166  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  22.63 
 
 		 666 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  21.74 
 
 		 731 aa  162  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.94 
 
 		 741 aa  161  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 751 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.37 
 
 		 737 aa  159  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 747 aa  159  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  23.81 
 
 		 753 aa  159  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  23.81 
 
 		 751 aa  159  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 751 aa  159  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 747 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 751 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.45 
 
 		 785 aa  158  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.67 
 
 		 753 aa  157  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.67 
 
 		 753 aa  156  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 		 1073 aa  156  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  27.53 
 
 		 620 aa  155  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 946 aa  155  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 946 aa  155  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.94 
 
 		 729 aa  154  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.61 
 
 		 745 aa  154  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.73 
 
 		 742 aa  154  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.44 
 
 		 773 aa  153  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.36 
 
 		 763 aa  153  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 768 aa  152  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.54 
 
 		 730 aa  152  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 741 aa  152  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.54 
 
 		 730 aa  152  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.32 
 
 		 678 aa  152  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 786 aa  151  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.4 
 
 		 747 aa  150  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.05 
 
 		 754 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.15 
 
 		 1111 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  24.04 
 
 		 789 aa  149  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.38 
 
 		 762 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 743 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.15 
 
 		 765 aa  149  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 790 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  23.61 
 
 		 678 aa  148  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.05 
 
 		 858 aa  148  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.44 
 
 		 795 aa  148  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.58 
 
 		 783 aa  147  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 840 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  27.93 
 
 		 706 aa  146  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 		 786 aa  146  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.73 
 
 		 743 aa  146  2e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 671 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.31 
 
 		 671 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.41 
 
 		 755 aa  145  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  24.19 
 
 		 757 aa  145  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 671 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 680 aa  145  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 787 aa  145  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  23.05 
 
 		 749 aa  145  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.53 
 
 		 794 aa  144  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  23.34 
 
 		 655 aa  144  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.16 
 
 		 715 aa  144  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 		 787 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 779 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  24.34 
 
 		 764 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 797 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 		 707 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>