More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2143 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1099 aa  2113    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.07 
 
 		 1066 aa  611  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  40.88 
 
 		 1044 aa  581  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  40.57 
 
 		 1050 aa  575  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.15 
 
 		 1051 aa  566  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  40.18 
 
 		 1060 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  41.17 
 
 		 1144 aa  552  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  40.89 
 
 		 1074 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  40.4 
 
 		 1059 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  42 
 
 		 1062 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  41.39 
 
 		 1096 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  39.89 
 
 		 1051 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  39.89 
 
 		 1051 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  39.82 
 
 		 1051 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  39 
 
 		 1094 aa  509  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  38.61 
 
 		 1055 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  38.85 
 
 		 1095 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  38.06 
 
 		 1040 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  37.92 
 
 		 1129 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  37.57 
 
 		 1038 aa  492  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  38.74 
 
 		 1038 aa  492  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  36.28 
 
 		 1134 aa  465  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  38.16 
 
 		 1135 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  38.15 
 
 		 1103 aa  413  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  37.41 
 
 		 1076 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  32.73 
 
 		 1197 aa  376  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  36.82 
 
 		 1098 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.57 
 
 		 1124 aa  362  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  29.9 
 
 		 1059 aa  336  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  31.49 
 
 		 1115 aa  313  7.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  34.2 
 
 		 1085 aa  309  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.41 
 
 		 1083 aa  307  6e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.54 
 
 		 1145 aa  301  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  31.09 
 
 		 1150 aa  287  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.85 
 
 		 1058 aa  248  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  43.06 
 
 		 1060 aa  244  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  29.75 
 
 		 707 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.59 
 
 		 742 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  26.4 
 
 		 743 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.08 
 
 		 713 aa  141  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 786 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 666 aa  139  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.54 
 
 		 783 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  27.4 
 
 		 721 aa  137  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  28.61 
 
 		 739 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.31 
 
 		 671 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 		 783 aa  136  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 786 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.65 
 
 		 795 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  27.61 
 
 		 728 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 786 aa  132  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 678 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  22.18 
 
 		 731 aa  132  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  28.27 
 
 		 706 aa  132  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  30.67 
 
 		 1162 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  27.61 
 
 		 728 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 671 aa  131  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  28.61 
 
 		 1041 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.7 
 
 		 797 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  31.84 
 
 		 1050 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  27.9 
 
 		 671 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  21.94 
 
 		 722 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  31.39 
 
 		 685 aa  129  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.25 
 
 		 768 aa  129  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.78 
 
 		 831 aa  129  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.6 
 
 		 757 aa  129  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 744 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  28.85 
 
 		 1111 aa  129  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.09 
 
 		 788 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  25.21 
 
 		 722 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  25.21 
 
 		 722 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  25.21 
 
 		 722 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.23 
 
 		 732 aa  128  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  25.53 
 
 		 900 aa  128  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.02 
 
 		 892 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  25.07 
 
 		 722 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 735 aa  127  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  28.67 
 
 		 1108 aa  127  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 		 729 aa  126  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.69 
 
 		 763 aa  127  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  24.02 
 
 		 639 aa  125  3e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 788 aa  125  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  27.83 
 
 		 736 aa  125  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.4 
 
 		 726 aa  125  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  26.46 
 
 		 717 aa  125  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  25.48 
 
 		 722 aa  125  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.25 
 
 		 794 aa  125  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.69 
 
 		 1023 aa  125  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.13 
 
 		 671 aa  124  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 		 759 aa  124  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 826 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.02 
 
 		 758 aa  124  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  25.58 
 
 		 688 aa  124  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  25.38 
 
 		 722 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  28.84 
 
 		 797 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 738 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.32 
 
 		 730 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.4 
 
 		 768 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  23.82 
 
 		 706 aa  122  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 620 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>