More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1421 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  46.74 
 
 
1094 aa  679    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  70.29 
 
 
1038 aa  1347    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.39 
 
 
1066 aa  724    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1051 aa  2023    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  45.84 
 
 
1050 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  47 
 
 
1129 aa  759    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  97.62 
 
 
1051 aa  1916    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1051 aa  2023    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  73.03 
 
 
1038 aa  1404    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  65.15 
 
 
1055 aa  1239    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  38.58 
 
 
1044 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  38.83 
 
 
1060 aa  529  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.05 
 
 
1051 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  38.31 
 
 
1074 aa  505  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  38.74 
 
 
1095 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  39.28 
 
 
1144 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  40.28 
 
 
1062 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  38.95 
 
 
1059 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  37.58 
 
 
1040 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 
1096 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  39.26 
 
 
1099 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  33.83 
 
 
1134 aa  432  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  37.54 
 
 
1076 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.31 
 
 
1145 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  35.29 
 
 
1103 aa  364  4e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  34.12 
 
 
1060 aa  364  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  34.11 
 
 
1135 aa  363  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  33.4 
 
 
1115 aa  355  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.89 
 
 
1124 aa  353  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.36 
 
 
1083 aa  351  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  30.9 
 
 
1059 aa  343  9e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  34.77 
 
 
1085 aa  319  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  33.61 
 
 
1150 aa  316  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.39 
 
 
1058 aa  263  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  40.41 
 
 
1098 aa  260  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  33.75 
 
 
1197 aa  245  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.17 
 
 
1019 aa  124  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 
1103 aa  112  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.43 
 
 
730 aa  100  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.3 
 
 
755 aa  99  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  19.88 
 
 
946 aa  98.2  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  19.88 
 
 
946 aa  98.2  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  21.99 
 
 
1066 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.37 
 
 
729 aa  96.3  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 
1041 aa  95.5  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.15 
 
 
1023 aa  95.5  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  19.2 
 
 
666 aa  95.5  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  19.24 
 
 
722 aa  93.2  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  21.51 
 
 
1041 aa  93.6  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 
680 aa  91.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  25.85 
 
 
1180 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  22.6 
 
 
743 aa  90.1  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  20.41 
 
 
807 aa  89.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  23 
 
 
900 aa  86.7  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 
817 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 
759 aa  84.7  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.57 
 
 
730 aa  84.7  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 
798 aa  84.7  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.57 
 
 
730 aa  84.7  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.77 
 
 
729 aa  84.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  18.58 
 
 
735 aa  83.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.33 
 
 
715 aa  82.8  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  21.26 
 
 
757 aa  83.2  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  21.29 
 
 
772 aa  82  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1518  ATP-dependent helicase PcrA  26.56 
 
 
766 aa  80.9  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.291194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  29.24 
 
 
1144 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  17.68 
 
 
731 aa  79.3  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  29 
 
 
1162 aa  79  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.14 
 
 
731 aa  79  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  21.79 
 
 
657 aa  79  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  22.99 
 
 
705 aa  79  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  21.75 
 
 
685 aa  78.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  22.21 
 
 
620 aa  79  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 
795 aa  78.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.62 
 
 
759 aa  78.6  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  18.3 
 
 
625 aa  78.2  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  24.37 
 
 
804 aa  78.2  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  24.29 
 
 
726 aa  77.4  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  19.15 
 
 
638 aa  77.4  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  24.86 
 
 
797 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.72 
 
 
741 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.18 
 
 
757 aa  77  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.97 
 
 
640 aa  76.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  25.88 
 
 
730 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3158  UvrD/REP helicase  21.47 
 
 
706 aa  77  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154088  normal  0.513844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  27.81 
 
 
1162 aa  77  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.42 
 
 
737 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  22.8 
 
 
723 aa  77  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 
1177 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  19.8 
 
 
749 aa  76.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.79 
 
 
1052 aa  76.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  24.43 
 
 
1128 aa  75.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  20.2 
 
 
724 aa  75.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  21.2 
 
 
723 aa  75.5  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0554  UvrD/REP helicase  22.45 
 
 
705 aa  75.5  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358681  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.38 
 
 
758 aa  75.5  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2706  UvrD/REP helicase  23.59 
 
 
704 aa  75.1  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.341733 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  20.57 
 
 
770 aa  75.1  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 
1128 aa  75.1  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  22.67 
 
 
689 aa  75.1  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>