More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1776 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.58 
 
 		 1051 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.56 
 
 		 1066 aa  662    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  44.59 
 
 		 1044 aa  723    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  44.28 
 
 		 1060 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  45.16 
 
 		 1059 aa  728    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  42.55 
 
 		 1050 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  44.76 
 
 		 1074 aa  693    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  45.46 
 
 		 1062 aa  677    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1095 aa  2102    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  46.99 
 
 		 1096 aa  678    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  40.24 
 
 		 1040 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  41.47 
 
 		 1098 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.05 
 
 		 1124 aa  545  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  38.39 
 
 		 1115 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  38.9 
 
 		 1051 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  38.9 
 
 		 1051 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  39.69 
 
 		 1038 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  37.82 
 
 		 1129 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  41.25 
 
 		 1076 aa  529  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  37.38 
 
 		 1055 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  38.48 
 
 		 1038 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  39.03 
 
 		 1094 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  37.15 
 
 		 1150 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  35.95 
 
 		 1134 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  38.22 
 
 		 1099 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  36.38 
 
 		 1135 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  37.4 
 
 		 1060 aa  466  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  45.17 
 
 		 1144 aa  459  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  37.63 
 
 		 1103 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  32.88 
 
 		 1059 aa  432  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  39.21 
 
 		 1085 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.41 
 
 		 1083 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  40.48 
 
 		 1197 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.99 
 
 		 1145 aa  379  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.43 
 
 		 1058 aa  317  7e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  44.16 
 
 		 1051 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  27.18 
 
 		 1108 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 1019 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.73 
 
 		 694 aa  135  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  29.32 
 
 		 1144 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.7 
 
 		 763 aa  132  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  28.9 
 
 		 1162 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  20.52 
 
 		 731 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.61 
 
 		 773 aa  131  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.59 
 
 		 797 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  23.01 
 
 		 672 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.86 
 
 		 838 aa  128  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.15 
 
 		 730 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.96 
 
 		 896 aa  127  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 		 743 aa  125  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 1124 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  22.25 
 
 		 757 aa  123  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 1103 aa  122  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.47 
 
 		 772 aa  121  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.45 
 
 		 794 aa  121  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  24.45 
 
 		 688 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 		 726 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.13 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 785 aa  119  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.07 
 
 		 833 aa  119  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.72 
 
 		 829 aa  119  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.69 
 
 		 858 aa  118  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.8 
 
 		 794 aa  116  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.35 
 
 		 729 aa  117  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  24.64 
 
 		 778 aa  116  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 666 aa  116  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  24.09 
 
 		 762 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.32 
 
 		 1228 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  32.54 
 
 		 674 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  20.43 
 
 		 1041 aa  115  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.2 
 
 		 762 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  28.66 
 
 		 706 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  24.8 
 
 		 768 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  24.71 
 
 		 705 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 659 aa  112  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.38 
 
 		 806 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.2 
 
 		 1023 aa  112  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  31.85 
 
 		 1032 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.49 
 
 		 864 aa  112  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.24 
 
 		 672 aa  111  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  27.97 
 
 		 1132 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.6 
 
 		 768 aa  111  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 1073 aa  111  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.55 
 
 		 932 aa  111  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.11 
 
 		 1090 aa  111  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  23.06 
 
 		 900 aa  110  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  27.42 
 
 		 714 aa  110  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.84 
 
 		 732 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.75 
 
 		 828 aa  110  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.65 
 
 		 745 aa  110  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  22.12 
 
 		 1066 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 		 1232 aa  110  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  30.75 
 
 		 1124 aa  110  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  31.21 
 
 		 751 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 1128 aa  110  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.06 
 
 		 741 aa  110  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.44 
 
 		 671 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.76 
 
 		 781 aa  108  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  31.6 
 
 		 728 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  29.61 
 
 		 736 aa  108  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>