More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8377 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  60.13 
 
 		 1060 aa  1138    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  44.31 
 
 		 1050 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  62.23 
 
 		 1059 aa  1192    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  59.01 
 
 		 1044 aa  1137    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  48.14 
 
 		 1096 aa  763    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  42.09 
 
 		 1135 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 1051 aa  2075    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  67.73 
 
 		 1074 aa  1283    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  42.37 
 
 		 1040 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  43.79 
 
 		 1134 aa  700    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  48.34 
 
 		 1062 aa  755    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  45 
 
 		 1066 aa  715    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  43.49 
 
 		 1095 aa  678    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  44.98 
 
 		 1060 aa  675    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  46.3 
 
 		 1144 aa  759    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  41.98 
 
 		 1103 aa  592  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  38.76 
 
 		 1129 aa  562  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  39.08 
 
 		 1055 aa  562  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  39.08 
 
 		 1099 aa  542  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  38.49 
 
 		 1038 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  37.83 
 
 		 1038 aa  539  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  38.42 
 
 		 1051 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  38.42 
 
 		 1051 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  38.24 
 
 		 1051 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  36.84 
 
 		 1115 aa  515  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  36.84 
 
 		 1094 aa  513  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.8 
 
 		 1124 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  38.99 
 
 		 1076 aa  495  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  35.65 
 
 		 1150 aa  476  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  34.25 
 
 		 1059 aa  466  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.59 
 
 		 1145 aa  416  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  37.12 
 
 		 1085 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.09 
 
 		 1083 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  44.75 
 
 		 1098 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  37.66 
 
 		 1197 aa  363  7.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.02 
 
 		 1058 aa  312  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  31.26 
 
 		 1103 aa  197  9e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  23.67 
 
 		 946 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  23.67 
 
 		 946 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  29.24 
 
 		 1091 aa  191  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.31 
 
 		 671 aa  190  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 		 731 aa  188  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.18 
 
 		 729 aa  187  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 707 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.64 
 
 		 785 aa  185  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.63 
 
 		 745 aa  184  8.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  30.99 
 
 		 671 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  30.85 
 
 		 671 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  31.95 
 
 		 1108 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  31.66 
 
 		 1111 aa  181  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  28.51 
 
 		 728 aa  181  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  25.58 
 
 		 638 aa  181  9e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  24.17 
 
 		 666 aa  178  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 706 aa  177  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.45 
 
 		 743 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  32.87 
 
 		 1162 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  33.25 
 
 		 1144 aa  173  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  27.19 
 
 		 680 aa  172  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 		 681 aa  171  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.58 
 
 		 741 aa  171  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  24.86 
 
 		 722 aa  171  8e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  29.4 
 
 		 1091 aa  171  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.06 
 
 		 763 aa  171  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  29.4 
 
 		 1091 aa  171  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 1091 aa  171  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.26 
 
 		 817 aa  170  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  30.87 
 
 		 1101 aa  170  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 736 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.83 
 
 		 858 aa  169  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.84 
 
 		 755 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.94 
 
 		 658 aa  168  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  31.66 
 
 		 1162 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  27.13 
 
 		 900 aa  168  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.98 
 
 		 851 aa  167  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 665 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  29.73 
 
 		 739 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  31.66 
 
 		 1124 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  29.5 
 
 		 1073 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.44 
 
 		 762 aa  164  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.29 
 
 		 715 aa  164  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  27.52 
 
 		 678 aa  164  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  36.45 
 
 		 682 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.06 
 
 		 747 aa  163  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  25.88 
 
 		 682 aa  164  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  25.9 
 
 		 672 aa  163  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 1041 aa  163  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.94 
 
 		 849 aa  163  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.6 
 
 		 732 aa  163  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.88 
 
 		 1176 aa  162  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.82 
 
 		 751 aa  162  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  30.07 
 
 		 1128 aa  162  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.82 
 
 		 753 aa  162  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.82 
 
 		 751 aa  162  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 		 688 aa  162  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.82 
 
 		 751 aa  162  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.82 
 
 		 751 aa  161  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.58 
 
 		 747 aa  162  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.55 
 
 		 753 aa  161  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.48 
 
 		 738 aa  161  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 741 aa  161  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>