218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11360 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 1058 aa  1994    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  39.09 
 
 		 1076 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.87 
 
 		 1124 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  33.06 
 
 		 1059 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  36.67 
 
 		 1085 aa  349  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  34.13 
 
 		 1044 aa  347  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  34.38 
 
 		 1059 aa  343  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.6 
 
 		 1066 aa  342  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.46 
 
 		 1145 aa  337  1e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  34.06 
 
 		 1040 aa  333  9e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  35.77 
 
 		 1098 aa  330  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 		 1115 aa  329  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  33.15 
 
 		 1060 aa  325  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.69 
 
 		 1051 aa  316  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  33.58 
 
 		 1074 aa  315  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  34.41 
 
 		 1144 aa  312  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  32.9 
 
 		 1055 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  33.91 
 
 		 1038 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  34.43 
 
 		 1095 aa  307  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  32.15 
 
 		 1150 aa  301  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  34.44 
 
 		 1096 aa  300  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  34.82 
 
 		 1062 aa  298  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 		 1094 aa  295  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  33.55 
 
 		 1038 aa  294  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  33.95 
 
 		 1050 aa  293  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1051 aa  280  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  32.76 
 
 		 1051 aa  277  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  32.76 
 
 		 1051 aa  277  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  32.74 
 
 		 1135 aa  274  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  29.54 
 
 		 1134 aa  273  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  32.21 
 
 		 1129 aa  271  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.87 
 
 		 1083 aa  256  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  33.12 
 
 		 1103 aa  239  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  31.74 
 
 		 1099 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  30.55 
 
 		 1060 aa  226  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  41.37 
 
 		 1197 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  26.98 
 
 		 1428 aa  87.4  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1154  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1528 aa  82.4  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.83 
 
 		 1019 aa  75.1  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 738 aa  67.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  20.76 
 
 		 735 aa  66.2  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.23 
 
 		 738 aa  66.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.59 
 
 		 751 aa  66.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.68 
 
 		 755 aa  65.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  21.76 
 
 		 656 aa  65.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.46 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.68 
 
 		 751 aa  65.1  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 		 738 aa  64.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.46 
 
 		 729 aa  63.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.82 
 
 		 772 aa  62.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 768 aa  62.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  29.59 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  24.43 
 
 		 757 aa  61.6  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 		 797 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  24.5 
 
 		 706 aa  60.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  29.94 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.26 
 
 		 773 aa  58.9  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  28.57 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.04 
 
 		 737 aa  58.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 		 798 aa  58.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  26.25 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06510  ATP-dependent DNA helicase pcra, putative  25.58 
 
 		 982 aa  58.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 1033 aa  58.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  24.83 
 
 		 812 aa  57.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.12 
 
 		 715 aa  57  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  27.6 
 
 		 816 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.17 
 
 		 730 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  26.25 
 
 		 795 aa  57  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  23.58 
 
 		 762 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.75 
 
 		 587 aa  55.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 1027 aa  55.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2400  UvrD/REP helicase  23.24 
 
 		 1194 aa  55.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.59 
 
 		 1016 aa  54.7  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 707 aa  54.7  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.27 
 
 		 1023 aa  54.7  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  29.95 
 
 		 715 aa  54.3  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  25.66 
 
 		 1052 aa  54.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.37 
 
 		 674 aa  53.5  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  21.52 
 
 		 726 aa  53.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.35 
 
 		 892 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  30.59 
 
 		 295 aa  53.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  22.51 
 
 		 655 aa  53.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.52 
 
 		 817 aa  53.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03797  DNA helicase and DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.1 
 
 		 997 aa  52.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  21.04 
 
 		 724 aa  52.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.49 
 
 		 786 aa  52.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  23.33 
 
 		 1041 aa  52.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  27.31 
 
 		 1162 aa  52.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.06 
 
 		 841 aa  52  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  23.61 
 
 		 762 aa  52  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  26.9 
 
 		 741 aa  51.6  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  22.54 
 
 		 678 aa  51.6  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.73 
 
 		 747 aa  51.6  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.17 
 
 		 662 aa  51.2  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  23.17 
 
 		 662 aa  51.2  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  23.62 
 
 		 900 aa  51.2  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  22.8 
 
 		 677 aa  50.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.23 
 
 		 753 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  26.96 
 
 		 1073 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  26.43 
 
 		 1032 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>