More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1457 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.39 
 
 		 1066 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  70 
 
 		 1038 aa  1341    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  45.7 
 
 		 1050 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  46.45 
 
 		 1129 aa  750    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1051 aa  2025    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  65.12 
 
 		 1055 aa  1235    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  97.62 
 
 		 1051 aa  1938    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  97.62 
 
 		 1051 aa  1938    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  72.65 
 
 		 1038 aa  1400    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  45.86 
 
 		 1094 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  38.15 
 
 		 1044 aa  525  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  38.41 
 
 		 1060 aa  522  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.87 
 
 		 1051 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  38.36 
 
 		 1074 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  40.77 
 
 		 1062 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  38.63 
 
 		 1095 aa  499  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  38.66 
 
 		 1059 aa  488  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  38.94 
 
 		 1144 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  37.83 
 
 		 1040 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  39.35 
 
 		 1096 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  39.19 
 
 		 1099 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  33.89 
 
 		 1134 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  37.48 
 
 		 1076 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.37 
 
 		 1124 aa  383  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.06 
 
 		 1145 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  35.4 
 
 		 1103 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  33.93 
 
 		 1135 aa  361  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  33.85 
 
 		 1060 aa  358  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  33.68 
 
 		 1115 aa  356  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.08 
 
 		 1083 aa  346  1e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  30.74 
 
 		 1059 aa  344  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  35.04 
 
 		 1085 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  33.67 
 
 		 1150 aa  313  9e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  40.6 
 
 		 1098 aa  265  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.96 
 
 		 1058 aa  262  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 		 1197 aa  242  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.37 
 
 		 1019 aa  124  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 1103 aa  103  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.69 
 
 		 755 aa  102  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.05 
 
 		 730 aa  101  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  20.03 
 
 		 666 aa  100  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  21.88 
 
 		 1066 aa  98.2  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  21.81 
 
 		 1041 aa  97.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  19.77 
 
 		 946 aa  94.7  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  19.77 
 
 		 946 aa  94.7  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.96 
 
 		 729 aa  94.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 1180 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  25.63 
 
 		 1041 aa  93.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  19.84 
 
 		 807 aa  90.1  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.74 
 
 		 1023 aa  89.7  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  22.77 
 
 		 743 aa  88.2  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.91 
 
 		 715 aa  87.4  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  22.43 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 817 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  19.01 
 
 		 722 aa  84  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  23.13 
 
 		 759 aa  84.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  17.68 
 
 		 731 aa  84  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  21.34 
 
 		 772 aa  83.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.89 
 
 		 741 aa  81.3  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.93 
 
 		 729 aa  80.9  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.66 
 
 		 757 aa  80.9  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  21.61 
 
 		 685 aa  80.5  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 804 aa  80.5  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  22.82 
 
 		 787 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.89 
 
 		 640 aa  80.1  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  21.16 
 
 		 757 aa  80.1  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.12 
 
 		 737 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 798 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  18.73 
 
 		 735 aa  79.3  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.66 
 
 		 730 aa  79.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  19.74 
 
 		 687 aa  79.3  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.66 
 
 		 730 aa  79.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  25.14 
 
 		 1177 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  19.86 
 
 		 749 aa  78.2  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  22.8 
 
 		 723 aa  78.2  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  22.35 
 
 		 900 aa  77.4  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.6 
 
 		 725 aa  77.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  18.57 
 
 		 625 aa  77.4  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  23.41 
 
 		 705 aa  77.4  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  24.29 
 
 		 726 aa  76.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  29.12 
 
 		 1144 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.54 
 
 		 731 aa  77  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.48 
 
 		 672 aa  77  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  24.97 
 
 		 795 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.8 
 
 		 759 aa  75.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  23.06 
 
 		 689 aa  75.9  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.35 
 
 		 762 aa  75.5  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  27.81 
 
 		 1162 aa  75.5  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  23.82 
 
 		 1048 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.41 
 
 		 658 aa  75.1  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  24.57 
 
 		 730 aa  75.1  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  25.51 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  18.54 
 
 		 714 aa  74.7  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.23 
 
 		 751 aa  74.7  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.71 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.48 
 
 		 1052 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 1128 aa  73.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  20.72 
 
 		 754 aa  74.3  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.53 
 
 		 785 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 707 aa  73.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>