More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7808 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1134 aa  2246    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  43.57 
 
 		 1044 aa  694    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.79 
 
 		 1051 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  43.57 
 
 		 1059 aa  688    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  48.65 
 
 		 1103 aa  789    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  47.33 
 
 		 1135 aa  854    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  43.37 
 
 		 1074 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  45.32 
 
 		 1060 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  44.33 
 
 		 1060 aa  774    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  39.24 
 
 		 1144 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  40.38 
 
 		 1096 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  41.06 
 
 		 1062 aa  555  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 1050 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.12 
 
 		 1066 aa  527  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  35.88 
 
 		 1040 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  35.86 
 
 		 1095 aa  458  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  33.48 
 
 		 1055 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  33.84 
 
 		 1038 aa  439  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  33.9 
 
 		 1038 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1129 aa  432  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  34.36 
 
 		 1051 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  34.36 
 
 		 1051 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  34.24 
 
 		 1051 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  34.15 
 
 		 1094 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  34.38 
 
 		 1076 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  34.57 
 
 		 1098 aa  390  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.65 
 
 		 1124 aa  379  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  32.11 
 
 		 1115 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 1150 aa  355  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 1059 aa  342  2.9999999999999998e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.88 
 
 		 1145 aa  321  6e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  31.13 
 
 		 1085 aa  279  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.7 
 
 		 1083 aa  272  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  34.41 
 
 		 1197 aa  266  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.13 
 
 		 1058 aa  242  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  34.41 
 
 		 1099 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 807 aa  174  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 731 aa  172  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  23.44 
 
 		 946 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  23.44 
 
 		 946 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  26.07 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  25.94 
 
 		 720 aa  151  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.85 
 
 		 797 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  29.46 
 
 		 1128 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.14 
 
 		 707 aa  147  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  28.42 
 
 		 1108 aa  146  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.1 
 
 		 741 aa  146  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  29.23 
 
 		 1124 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 812 aa  145  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  25.23 
 
 		 720 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  30.59 
 
 		 726 aa  143  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  28.81 
 
 		 1101 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  25.23 
 
 		 720 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  25.23 
 
 		 720 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  29.71 
 
 		 1128 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  25.23 
 
 		 720 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  27.84 
 
 		 1041 aa  141  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  29.21 
 
 		 668 aa  140  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  29.62 
 
 		 721 aa  140  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  25.1 
 
 		 720 aa  140  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  24.78 
 
 		 678 aa  140  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 678 aa  140  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.09 
 
 		 737 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.18 
 
 		 755 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 		 1073 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  29.38 
 
 		 721 aa  139  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.07 
 
 		 742 aa  139  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1048 aa  138  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.99 
 
 		 794 aa  137  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 747 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  24.48 
 
 		 658 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.44 
 
 		 1228 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  25.16 
 
 		 720 aa  137  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.39 
 
 		 715 aa  137  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 1103 aa  136  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  26.54 
 
 		 735 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.33 
 
 		 658 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  25.92 
 
 		 720 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.08 
 
 		 814 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  25.92 
 
 		 720 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  30.62 
 
 		 762 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  25.92 
 
 		 720 aa  135  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  25.98 
 
 		 688 aa  134  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 		 789 aa  134  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  27.29 
 
 		 736 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  25.74 
 
 		 762 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  27.62 
 
 		 666 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.77 
 
 		 730 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  30.34 
 
 		 739 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  30.93 
 
 		 1016 aa  132  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.54 
 
 		 892 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  27.81 
 
 		 1150 aa  131  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6683  UvrD/REP helicase  27.03 
 
 		 966 aa  131  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0759039  normal  0.87543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  32.43 
 
 		 1124 aa  131  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.06 
 
 		 735 aa  131  9.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.61 
 
 		 729 aa  131  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  28.55 
 
 		 1111 aa  130  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  25 
 
 		 721 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.45 
 
 		 725 aa  131  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>