More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6683 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6683  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 966 aa  1998    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0759039  normal  0.87543 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1496  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 851 aa  270  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 946 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 946 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 		 921 aa  219  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0230  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 751 aa  208  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2615  UvrD/REP helicase  51.44 
 
 		 246 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.328239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 672 aa  204  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 		 845 aa  203  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.38 
 
 		 671 aa  200  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  29.3 
 
 		 739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  31.12 
 
 		 768 aa  198  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.04 
 
 		 785 aa  196  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  29.72 
 
 		 671 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 807 aa  196  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  29.72 
 
 		 671 aa  195  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 741 aa  194  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 		 665 aa  194  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.81 
 
 		 833 aa  194  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.66 
 
 		 781 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.66 
 
 		 715 aa  191  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  25.13 
 
 		 920 aa  191  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  27.91 
 
 		 787 aa  191  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.35 
 
 		 705 aa  188  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.1 
 
 		 673 aa  187  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  29.78 
 
 		 728 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  29.78 
 
 		 728 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 668 aa  186  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  29.11 
 
 		 759 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.61 
 
 		 754 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  27.99 
 
 		 678 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.62 
 
 		 742 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 		 790 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.97 
 
 		 762 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.61 
 
 		 773 aa  185  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  27.98 
 
 		 721 aa  186  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.37 
 
 		 707 aa  185  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  29.6 
 
 		 736 aa  185  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  28.27 
 
 		 744 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  32.63 
 
 		 799 aa  184  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  31.1 
 
 		 729 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  32.54 
 
 		 786 aa  184  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.49 
 
 		 783 aa  184  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  34.12 
 
 		 706 aa  184  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  33.25 
 
 		 783 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  33.02 
 
 		 787 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.59 
 
 		 858 aa  183  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  29.78 
 
 		 728 aa  184  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  27.72 
 
 		 666 aa  183  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.88 
 
 		 787 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 787 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 678 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  33.57 
 
 		 726 aa  182  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 846 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 787 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  28.37 
 
 		 731 aa  181  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.03 
 
 		 756 aa  182  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 787 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 840 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  29.46 
 
 		 727 aa  181  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  33.01 
 
 		 797 aa  181  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.67 
 
 		 731 aa  181  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  33.01 
 
 		 797 aa  181  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  32.54 
 
 		 787 aa  181  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.43 
 
 		 787 aa  180  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  32.54 
 
 		 787 aa  181  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  32.54 
 
 		 787 aa  180  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 714 aa  180  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  32.78 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  32.54 
 
 		 787 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  32.54 
 
 		 787 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  31.94 
 
 		 769 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  30.16 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.65 
 
 		 772 aa  179  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  32.54 
 
 		 787 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  32.54 
 
 		 787 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  32.22 
 
 		 760 aa  179  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  36.91 
 
 		 678 aa  178  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 738 aa  178  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.43 
 
 		 795 aa  178  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  29.97 
 
 		 727 aa  178  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  29.4 
 
 		 743 aa  178  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  32.71 
 
 		 795 aa  178  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.96 
 
 		 755 aa  178  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.25 
 
 		 797 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.13 
 
 		 794 aa  178  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.99 
 
 		 694 aa  177  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  31.67 
 
 		 668 aa  177  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  29.55 
 
 		 727 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.41 
 
 		 786 aa  177  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  32.94 
 
 		 798 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  32.47 
 
 		 795 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  37.46 
 
 		 749 aa  177  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  26.17 
 
 		 757 aa  177  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  27.75 
 
 		 742 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  32.39 
 
 		 731 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 		 741 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2313  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 		 984 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.86 
 
 		 841 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  32.46 
 
 		 783 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>