185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0779 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1197 aa  2271    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  56.44 
 
 		 1076 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  38.93 
 
 		 1059 aa  710    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  55.62 
 
 		 1124 aa  733    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  49.07 
 
 		 1085 aa  555  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  37.34 
 
 		 1150 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  35.3 
 
 		 1059 aa  479  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.87 
 
 		 1051 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  36.3 
 
 		 1060 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  35.99 
 
 		 1050 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.33 
 
 		 1083 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  38.48 
 
 		 1115 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  35.31 
 
 		 1040 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  42.7 
 
 		 1098 aa  402  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  40.02 
 
 		 1095 aa  392  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  33.39 
 
 		 1051 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  33.39 
 
 		 1051 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  36.78 
 
 		 1044 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  33.62 
 
 		 1135 aa  358  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  32.87 
 
 		 1099 aa  357  7.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  40.97 
 
 		 1062 aa  350  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.38 
 
 		 1145 aa  328  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  36.78 
 
 		 1129 aa  322  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  36.14 
 
 		 1038 aa  319  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  36.59 
 
 		 1038 aa  316  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  35.93 
 
 		 1051 aa  298  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  34.51 
 
 		 1055 aa  295  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 		 1134 aa  287  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  37.24 
 
 		 1103 aa  270  8.999999999999999e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.89 
 
 		 1058 aa  265  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  33.21 
 
 		 1060 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  46.38 
 
 		 1096 aa  250  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  44.58 
 
 		 1144 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.87 
 
 		 1066 aa  241  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  41.59 
 
 		 1074 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  38.34 
 
 		 1094 aa  166  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1154  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1528 aa  103  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193707 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  35.93 
 
 		 1428 aa  101  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  18.62 
 
 		 787 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  24.18 
 
 		 620 aa  68.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.51 
 
 		 743 aa  68.6  0.0000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  20.39 
 
 		 722 aa  67.8  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 1132 aa  67  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  26.61 
 
 		 1052 aa  66.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.1 
 
 		 1016 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.24 
 
 		 754 aa  62.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4135  UvrD/REP helicase  30.83 
 
 		 1143 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.47 
 
 		 781 aa  62.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.4 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.3 
 
 		 1032 aa  58.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  22.68 
 
 		 688 aa  58.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2446  UvrD/REP helicase  26.24 
 
 		 1141 aa  58.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.35 
 
 		 768 aa  57.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  18.39 
 
 		 731 aa  58.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.23 
 
 		 379 aa  57  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.01 
 
 		 783 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.64 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  26.51 
 
 		 379 aa  57  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  25.45 
 
 		 799 aa  57.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 		 786 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.81 
 
 		 1019 aa  57  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.43 
 
 		 932 aa  56.6  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  26.3 
 
 		 1050 aa  56.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  29.94 
 
 		 312 aa  56.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.83 
 
 		 797 aa  54.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  27.3 
 
 		 1041 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  21.65 
 
 		 706 aa  53.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 1124 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.73 
 
 		 755 aa  53.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 674 aa  52.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  22.01 
 
 		 946 aa  52.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.69 
 
 		 715 aa  52.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  22.01 
 
 		 946 aa  52.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 1001 aa  52.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.78 
 
 		 858 aa  52.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0968  UvrD/REP helicase  19.16 
 
 		 706 aa  52  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  24.25 
 
 		 741 aa  51.6  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  22.38 
 
 		 648 aa  51.6  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  22.38 
 
 		 648 aa  51.6  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0163  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 		 695 aa  51.6  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  23.17 
 
 		 762 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.55 
 
 		 762 aa  51.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2905  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 		 695 aa  51.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306179  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  23.49 
 
 		 695 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0150  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 		 695 aa  51.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 1144 aa  51.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.83 
 
 		 1023 aa  51.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  23.49 
 
 		 695 aa  51.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.5 
 
 		 745 aa  50.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.83 
 
 		 674 aa  50.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.91 
 
 		 670 aa  50.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.34 
 
 		 763 aa  50.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 1120 aa  50.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.52 
 
 		 833 aa  50.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  16.67 
 
 		 757 aa  50.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.55 
 
 		 785 aa  50.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 1162 aa  50.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  22.08 
 
 		 731 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 		 736 aa  50.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>