More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1801 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  46.83 
 
 		 1129 aa  740    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  44.99 
 
 		 1094 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  46.96 
 
 		 1050 aa  710    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.04 
 
 		 1066 aa  746    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  63.89 
 
 		 1055 aa  1212    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  73.03 
 
 		 1051 aa  1395    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  73.03 
 
 		 1051 aa  1395    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1038 aa  2025    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  72.55 
 
 		 1051 aa  1382    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  82.3 
 
 		 1038 aa  1623    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  38.14 
 
 		 1044 aa  548  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.4 
 
 		 1051 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  38.18 
 
 		 1060 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  39.15 
 
 		 1059 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  40.77 
 
 		 1096 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  38.13 
 
 		 1074 aa  512  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  39.53 
 
 		 1144 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  39.94 
 
 		 1062 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  39.51 
 
 		 1095 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  36.99 
 
 		 1040 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  38.14 
 
 		 1099 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  33.84 
 
 		 1134 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  37.48 
 
 		 1098 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.3 
 
 		 1124 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  34.89 
 
 		 1135 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  37.09 
 
 		 1076 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  34.06 
 
 		 1060 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  34.6 
 
 		 1115 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  35.58 
 
 		 1103 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.96 
 
 		 1145 aa  366  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  29.6 
 
 		 1059 aa  353  8e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.82 
 
 		 1083 aa  347  5e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  34.33 
 
 		 1085 aa  328  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  34.14 
 
 		 1150 aa  325  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.49 
 
 		 1058 aa  296  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  36.69 
 
 		 1197 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.21 
 
 		 729 aa  112  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  19.09 
 
 		 722 aa  111  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  20.41 
 
 		 946 aa  108  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  20.41 
 
 		 946 aa  108  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.55 
 
 		 730 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 1019 aa  105  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  21.61 
 
 		 1041 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.4 
 
 		 737 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  18.94 
 
 		 666 aa  97.4  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  21 
 
 		 749 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  25.24 
 
 		 1180 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.84 
 
 		 715 aa  93.6  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  20.34 
 
 		 807 aa  93.6  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 		 1177 aa  92  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  24.29 
 
 		 680 aa  90.5  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  25.39 
 
 		 707 aa  90.1  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.35 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.59 
 
 		 755 aa  90.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  24.55 
 
 		 817 aa  89  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 804 aa  89  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.84 
 
 		 759 aa  88.2  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  18.98 
 
 		 724 aa  87  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  22.06 
 
 		 1066 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  22.37 
 
 		 678 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.91 
 
 		 741 aa  86.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  20.19 
 
 		 769 aa  85.5  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.85 
 
 		 758 aa  85.1  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.59 
 
 		 772 aa  85.1  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  22.17 
 
 		 678 aa  85.1  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  19.33 
 
 		 723 aa  85.1  0.000000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.91 
 
 		 751 aa  84.7  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  21.39 
 
 		 665 aa  84.7  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.61 
 
 		 729 aa  83.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  23.61 
 
 		 826 aa  82.8  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  23.37 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.91 
 
 		 751 aa  82.8  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  18.77 
 
 		 735 aa  82.8  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 1103 aa  82.8  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 798 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  26.97 
 
 		 1073 aa  82.4  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  22.4 
 
 		 743 aa  82  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  24.09 
 
 		 787 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  23.33 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  18.53 
 
 		 714 aa  82  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.32 
 
 		 718 aa  81.6  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  22.57 
 
 		 786 aa  81.3  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  18.6 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  21.81 
 
 		 770 aa  80.9  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  18.86 
 
 		 689 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.35 
 
 		 730 aa  79.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  21.95 
 
 		 685 aa  79.7  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.35 
 
 		 730 aa  79.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.75 
 
 		 757 aa  79  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  19.53 
 
 		 696 aa  78.2  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.26 
 
 		 785 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.57 
 
 		 1023 aa  77.4  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  26.42 
 
 		 1428 aa  77.4  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  22.04 
 
 		 900 aa  76.6  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 790 aa  76.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  22 
 
 		 658 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.8 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  20.38 
 
 		 755 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 		 1041 aa  76.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  24.04 
 
 		 795 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>