103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_15100 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  43.38 
 
 		 1150 aa  701    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  43.25 
 
 		 1115 aa  741    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 1145 aa  2183    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.59 
 
 		 1124 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  39.31 
 
 		 1098 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  36.54 
 
 		 1050 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.42 
 
 		 1066 aa  432  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  32.68 
 
 		 1059 aa  425  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  39.15 
 
 		 1076 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  35.41 
 
 		 1044 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  37.03 
 
 		 1144 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  35.23 
 
 		 1060 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.91 
 
 		 1051 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  37.45 
 
 		 1096 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  36.51 
 
 		 1062 aa  396  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  35.73 
 
 		 1059 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  34.92 
 
 		 1055 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  33.99 
 
 		 1040 aa  389  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  36.02 
 
 		 1074 aa  382  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  35.63 
 
 		 1051 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  35.63 
 
 		 1051 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  37.14 
 
 		 1085 aa  373  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  34.46 
 
 		 1038 aa  370  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  35.2 
 
 		 1051 aa  366  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  33.93 
 
 		 1038 aa  366  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  33.25 
 
 		 1129 aa  354  5.9999999999999994e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.84 
 
 		 1083 aa  348  4e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  33.54 
 
 		 1094 aa  342  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  31.37 
 
 		 1134 aa  333  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  37.45 
 
 		 1197 aa  328  4.0000000000000003e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.12 
 
 		 1058 aa  324  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  32.92 
 
 		 1135 aa  323  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  33.02 
 
 		 1060 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  34.07 
 
 		 1103 aa  322  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  32.8 
 
 		 1099 aa  271  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  37.72 
 
 		 1095 aa  140  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  32.98 
 
 		 1428 aa  82.4  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  27.85 
 
 		 1041 aa  72.4  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  29.51 
 
 		 1162 aa  71.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1154  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1528 aa  68.9  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  23.56 
 
 		 641 aa  62.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  27.49 
 
 		 1124 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 1128 aa  57  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2706  UvrD/REP helicase  23.94 
 
 		 704 aa  56.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.341733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.62 
 
 		 715 aa  56.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 681 aa  56.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  40.66 
 
 		 714 aa  55.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  28.34 
 
 		 1016 aa  55.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  25.69 
 
 		 1108 aa  53.5  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4251  UvrD/REP helicase  26.11 
 
 		 715 aa  53.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.55 
 
 		 755 aa  53.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.19 
 
 		 742 aa  53.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  27.33 
 
 		 751 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  21.25 
 
 		 1041 aa  52.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  20.62 
 
 		 666 aa  52.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  24.41 
 
 		 804 aa  52.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.11 
 
 		 1111 aa  52  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  25.3 
 
 		 1073 aa  52  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2446  UvrD/REP helicase  23.34 
 
 		 1141 aa  51.6  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2458  UvrD/REP helicase  34.48 
 
 		 586 aa  50.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411519  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0968  UvrD/REP helicase  19.09 
 
 		 706 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  27.9 
 
 		 759 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  24.48 
 
 		 646 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  22.32 
 
 		 816 aa  50.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  26.03 
 
 		 1142 aa  49.7  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  16.59 
 
 		 666 aa  49.3  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1202  UvrD/REP helicase  22.47 
 
 		 1112 aa  49.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 719 aa  49.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  20.72 
 
 		 668 aa  48.9  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  24.04 
 
 		 774 aa  48.9  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  19.3 
 
 		 754 aa  48.5  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  31.31 
 
 		 284 aa  48.5  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 817 aa  48.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1048 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  32.05 
 
 		 709 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.54 
 
 		 730 aa  47.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1137  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  22.77 
 
 		 745 aa  47.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.931855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.48 
 
 		 1019 aa  47  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  20.92 
 
 		 772 aa  47.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 1033 aa  47.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  21.88 
 
 		 515 aa  47  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 742 aa  46.2  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  31.53 
 
 		 278 aa  46.2  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  36.67 
 
 		 760 aa  46.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  36.05 
 
 		 1161 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 674 aa  46.2  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  32.43 
 
 		 1064 aa  46.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  34.41 
 
 		 680 aa  46.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  41.33 
 
 		 1144 aa  45.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 		 1177 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  41.33 
 
 		 1162 aa  45.8  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  31.61 
 
 		 273 aa  45.8  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4135  UvrD/REP helicase  36.67 
 
 		 1143 aa  45.8  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 790 aa  45.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  38.16 
 
 		 700 aa  45.8  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  31.91 
 
 		 678 aa  45.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0721  UvrD/REP helicase  37.7 
 
 		 701 aa  45.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  24.29 
 
 		 739 aa  45.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  23.52 
 
 		 706 aa  45.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 726 aa  45.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>