121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0620 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  783    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  87.86 
 
 		 379 aa  693    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  85.75 
 
 		 379 aa  682    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  28.25 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.88 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  29.46 
 
 		 387 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  30.71 
 
 		 387 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  30.71 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  30.71 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  30.71 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  29.05 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  26.67 
 
 		 244 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  29.54 
 
 		 1052 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 		 1019 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  23.6 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  25.4 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  28.22 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  28.79 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 1016 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  27.34 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  23.66 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  26.56 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  27.4 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  24.47 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  30.18 
 
 		 1059 aa  73.9  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 946 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 946 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  25.7 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  26.32 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  24.74 
 
 		 970 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.81 
 
 		 1124 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  25.53 
 
 		 920 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  25.64 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  24.28 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  25.9 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 1060 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  26.88 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  26.19 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  26.49 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  26.49 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  26.49 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  27.44 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  28.26 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  25.38 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  26.92 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  26.32 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  26.56 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  23.2 
 
 		 1098 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  24.19 
 
 		 1062 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3553  hypothetical protein  25.67 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  24.26 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  25.1 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  26.04 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 1048 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.3 
 
 		 1058 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  30.08 
 
 		 1055 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  25.2 
 
 		 1076 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2313  UvrD/REP helicase  21.76 
 
 		 984 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  25.95 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  35.71 
 
 		 991 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  26.23 
 
 		 1197 aa  56.6  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  26.72 
 
 		 865 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_256  UvrD/REP helicase  23.51 
 
 		 972 aa  56.2  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000753871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  26.21 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  21.29 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  26.52 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  30.61 
 
 		 1040 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  24.33 
 
 		 311 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  22.85 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  26.07 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  28 
 
 		 803 aa  53.9  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 1144 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  23.33 
 
 		 351 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  24.32 
 
 		 298 aa  53.1  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 1038 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  22.44 
 
 		 1094 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  40.98 
 
 		 993 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  22.86 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  29.55 
 
 		 786 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  24.26 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  24.83 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  41.67 
 
 		 1099 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  25.44 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1051 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1051 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  24.4 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  23.76 
 
 		 1074 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  42.19 
 
 		 855 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  25.32 
 
 		 259 aa  50.4  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  20.97 
 
 		 1059 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  25.53 
 
 		 1060 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  24.08 
 
 		 1095 aa  49.7  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 1051 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  22.77 
 
 		 1045 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 1124 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  38.1 
 
 		 1106 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 1038 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  26.89 
 
 		 788 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2870  hypothetical protein  24.33 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.804578  normal  0.954362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>