100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2456 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  60.15 
 
 		 278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  59.33 
 
 		 291 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  60.15 
 
 		 277 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  60.15 
 
 		 277 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  60.15 
 
 		 277 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  57.35 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  56.87 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  57.3 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  55.95 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  52.26 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  54.05 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  48.58 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  50 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  50.74 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  53.05 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  54.09 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  51.7 
 
 		 299 aa  261  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  52.87 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  51.69 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  51.54 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  50.39 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  51.74 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  51.14 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  49.81 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  49.25 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  45.52 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  46.64 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  46.69 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  41.27 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  34.22 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  33.5 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  24.9 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 1019 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  30.52 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  25.41 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  31.34 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  27.76 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  29.72 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  28.03 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  30.23 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  30.88 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  23.37 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  26.64 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 1016 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  24.54 
 
 		 615 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  27.13 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.4 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1052 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  27.91 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.56 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  28.63 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  29.49 
 
 		 1059 aa  59.3  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.91 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.91 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.77 
 
 		 1124 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  27.97 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  26.47 
 
 		 1055 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1051 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1051 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1051 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  26.36 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  30.67 
 
 		 1135 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  25.99 
 
 		 783 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.5 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.14 
 
 		 1058 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  24.76 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.92 
 
 		 788 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.69 
 
 		 788 aa  49.3  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  23.05 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  22.26 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.92 
 
 		 788 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  27.21 
 
 		 1038 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  27.06 
 
 		 991 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.05 
 
 		 1176 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  20.7 
 
 		 803 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.84 
 
 		 958 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 		 1038 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  33.72 
 
 		 1262 aa  46.2  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  26.59 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  26.84 
 
 		 1130 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  28.12 
 
 		 781 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  30.82 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  30.85 
 
 		 913 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  22.78 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  27.45 
 
 		 1101 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  40.74 
 
 		 781 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 1040 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.24 
 
 		 1048 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 1159 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  26.34 
 
 		 1052 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  29.81 
 
 		 993 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1052 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  26.89 
 
 		 1106 aa  43.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 1076 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.44 
 
 		 962 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 		 1128 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  25.28 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  26.46 
 
 		 780 aa  42.4  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  30.99 
 
 		 1014 aa  42.4  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>