93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2007 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  100 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  60.59 
 
 		 297 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  61.4 
 
 		 302 aa  325  4.0000000000000003e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  56.64 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  56.06 
 
 		 280 aa  291  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  54.86 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  56.04 
 
 		 294 aa  285  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  55.08 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  55.98 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  54.04 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  53.05 
 
 		 333 aa  280  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  56.03 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  55.51 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  53.03 
 
 		 266 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  53.7 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  51.01 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  51.53 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  52.29 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  52.43 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  49.41 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  53.14 
 
 		 320 aa  258  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  51.53 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  51.53 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  51.53 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  49.43 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  51.55 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  52.26 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  50 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  47.27 
 
 		 323 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  46.22 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  37.45 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 1019 aa  99  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  23.9 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  25.16 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  29.04 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  33.09 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  29.64 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  30.97 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  22.4 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 1016 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  29.85 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  28.21 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  26.43 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  25.8 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  19.85 
 
 		 803 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  30.63 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1737  phage NTP-binding protein  22.78 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  28.85 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  24.57 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  25.67 
 
 		 783 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 		 1052 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  27.04 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.44 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  26.56 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 1059 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  26.34 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.11 
 
 		 379 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  23.13 
 
 		 379 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  24.16 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  32.1 
 
 		 1048 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  31.14 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.76 
 
 		 988 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 		 1197 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.31 
 
 		 1145 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  28.85 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.6 
 
 		 1124 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1061 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  26.16 
 
 		 781 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 1038 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  26.92 
 
 		 1106 aa  47  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 1051 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 1051 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  24.86 
 
 		 788 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  27.94 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  24.86 
 
 		 788 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 1051 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  33.12 
 
 		 1135 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  26.74 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  27.24 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  37.33 
 
 		 1164 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  30.54 
 
 		 913 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  20.51 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.13 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  24.86 
 
 		 788 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.13 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.5 
 
 		 915 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  30.83 
 
 		 1014 aa  42.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 1134 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  25.49 
 
 		 1066 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1151 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1291  hypothetical protein  20.38 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1395  hypothetical protein  20.62 
 
 		 248 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>