87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0903 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  97.93 
 
 
387 aa  739    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  88.63 
 
 
387 aa  701    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  781    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  99.48 
 
 
387 aa  778    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  90.18 
 
 
387 aa  681    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  99.48 
 
 
387 aa  778    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  89.41 
 
 
387 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  33.47 
 
 
379 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  30.9 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  30.71 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  30.63 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  29.25 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.17 
 
 
1019 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  29.37 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  27.13 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  29.5 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  27.96 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  28.68 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  25.82 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  29.17 
 
 
351 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  28.12 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.39 
 
 
302 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  28.35 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  29.86 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  29.18 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  28.4 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  29.39 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  25.52 
 
 
1052 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  25.98 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  27.76 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  27.13 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  27.96 
 
 
286 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  28.24 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  31.03 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  25.94 
 
 
299 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  28.4 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  21.77 
 
 
1016 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  27.2 
 
 
302 aa  63.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  27.3 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  27.24 
 
 
277 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  27.24 
 
 
277 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  27.24 
 
 
277 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  29.73 
 
 
297 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  30.29 
 
 
297 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  24.34 
 
 
276 aa  60.1  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  26.95 
 
 
259 aa  60.1  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  27.67 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  23.13 
 
 
411 aa  58.9  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  25.95 
 
 
287 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  27.13 
 
 
284 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  25.66 
 
 
298 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  27.82 
 
 
266 aa  57  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.43 
 
 
1124 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  27.88 
 
 
320 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3553  hypothetical protein  27.55 
 
 
279 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  25.84 
 
 
543 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  26.85 
 
 
273 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  26.34 
 
 
333 aa  56.2  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  28.28 
 
 
313 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  28.9 
 
 
1051 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  28.9 
 
 
1051 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  25.1 
 
 
263 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 
1051 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  28.48 
 
 
993 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  28.32 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  27.27 
 
 
991 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  25.26 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  25.45 
 
 
1134 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  21.96 
 
 
781 aa  47  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  26.67 
 
 
786 aa  47  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 
1060 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  26.89 
 
 
263 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 
1038 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 
1074 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 
1038 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  39.34 
 
 
1095 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  28.38 
 
 
1197 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  37.04 
 
 
1098 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  19.61 
 
 
946 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  19.61 
 
 
946 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  40.43 
 
 
940 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 
921 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  30.63 
 
 
1048 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  26.11 
 
 
1062 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  25.49 
 
 
1076 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.29 
 
 
957 aa  43.1  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.38 
 
 
1058 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>