96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1855 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  100 
 
 		 294 aa  579  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  61.74 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  59.72 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  61.89 
 
 		 295 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  61.74 
 
 		 286 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  56.79 
 
 		 303 aa  308  8e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  58.49 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  56.34 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  61.6 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  58.19 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  54.38 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  56.4 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  56.02 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  56.82 
 
 		 266 aa  291  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  59.77 
 
 		 320 aa  291  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  56.12 
 
 		 284 aa  291  9e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  55.72 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  56.6 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  55.15 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  53.24 
 
 		 273 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  54.38 
 
 		 304 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  52.69 
 
 		 291 aa  271  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  52.22 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  54.28 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  54.28 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  54.28 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  50.76 
 
 		 267 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  49.83 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  51.56 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  46.21 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  35.66 
 
 		 259 aa  132  9e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  31.49 
 
 		 366 aa  90.1  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  33.45 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  23.7 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  30.19 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  24.63 
 
 		 615 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 		 1019 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  29.66 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  28.37 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  28.12 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  26.02 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  27.8 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  28.01 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  28.95 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  29.7 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  23.66 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  29.77 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.04 
 
 		 1016 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  24.21 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  29.5 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  29.39 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  29.39 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  27.18 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  23.1 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  27.76 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 1052 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  30.29 
 
 		 1038 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  21.56 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  31.46 
 
 		 1055 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  31.79 
 
 		 1051 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  31.79 
 
 		 1051 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0229  hypothetical protein  21.28 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  26.94 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  31.13 
 
 		 1051 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  30.85 
 
 		 1094 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  26.05 
 
 		 543 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  25.09 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  32 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  23.16 
 
 		 783 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  23.91 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  24.03 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  29.31 
 
 		 1038 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29 
 
 		 958 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  23.48 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  25.35 
 
 		 969 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  25.35 
 
 		 969 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  35.33 
 
 		 1014 aa  45.8  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  27 
 
 		 780 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.87 
 
 		 1124 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.56 
 
 		 788 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  31.48 
 
 		 1064 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.38 
 
 		 957 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  30.65 
 
 		 1130 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  22.1 
 
 		 788 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  24.22 
 
 		 1066 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  34.12 
 
 		 1040 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 1062 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.47 
 
 		 1049 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  21.8 
 
 		 781 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  21.55 
 
 		 788 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  27.5 
 
 		 855 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  26.1 
 
 		 988 aa  43.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1057 aa  42.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1100 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 1101 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  33.87 
 
 		 986 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>