67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0737 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  91.39 
 
 		 302 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  56.68 
 
 		 276 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  51.82 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  52.33 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  50.17 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  54.38 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  51.68 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  46.26 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  52.36 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  29.52 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  28.3 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  25.4 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  29.6 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  29.93 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  29.06 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  31.29 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.92 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  28.73 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  30.48 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  31.41 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  31.41 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  31.41 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  29.67 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  30.38 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 1019 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  27 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  25.9 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  28.09 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  27.78 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  28.27 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  30.6 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  29.35 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  27.76 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  26.37 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  28.84 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  27.08 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  24.03 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  23.2 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  26.26 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  21.24 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  32.32 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  29.89 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  28.16 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  26.64 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  27.2 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  26.74 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  26.74 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  27.02 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  26.36 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  28.08 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  27.56 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  27.03 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  26.22 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 1052 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  22.39 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  29.63 
 
 		 781 aa  52.8  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  24.53 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  27.92 
 
 		 366 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.34 
 
 		 1016 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  22.59 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1073  hypothetical protein  29.17 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0101228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 1038 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0476  hypothetical protein  27.75 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000953683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  29.52 
 
 		 1172 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  27.43 
 
 		 781 aa  42.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  27.31 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>