77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0308 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  100 
 
 
244 aa  509  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 
1052 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25 
 
 
379 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.67 
 
 
379 aa  92  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  25.83 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  25.3 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  25.78 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 
1019 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  24.7 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  25 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  30.11 
 
 
1016 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  23.2 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  22.49 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  24.21 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  22.4 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  23.26 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  25.21 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  24.71 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  22.22 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  23.83 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  24.11 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  23.53 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  22.01 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  24.52 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  25.38 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  25.1 
 
 
411 aa  65.9  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  26.82 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  23.89 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  23.89 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  23.89 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  24.21 
 
 
333 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  23.47 
 
 
312 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  20.59 
 
 
293 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  25.94 
 
 
320 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  19.69 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  22.03 
 
 
313 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  23.66 
 
 
294 aa  62.4  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  20.8 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  26.23 
 
 
387 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  26.23 
 
 
387 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  25.82 
 
 
387 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  25.82 
 
 
387 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  25.82 
 
 
387 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  20.46 
 
 
302 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  23.55 
 
 
323 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  22.8 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  27.59 
 
 
351 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  21.24 
 
 
302 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  26.05 
 
 
387 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  21.84 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  19.92 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  22.54 
 
 
286 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  21.65 
 
 
297 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  25.29 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  29.25 
 
 
783 aa  49.7  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  22.48 
 
 
334 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  20.91 
 
 
1051 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  21.79 
 
 
1044 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  29.75 
 
 
786 aa  46.2  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 
1074 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0340  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 
951 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  20.53 
 
 
1051 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  20.53 
 
 
1051 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  24.21 
 
 
921 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  23.86 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  28.86 
 
 
794 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  23.17 
 
 
1098 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  40 
 
 
1140 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  22.78 
 
 
781 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  23.12 
 
 
1059 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  36.17 
 
 
1099 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  24.31 
 
 
960 aa  42.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6683  UvrD/REP helicase  23.38 
 
 
966 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0759039  normal  0.87543 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  49.02 
 
 
1052 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  49.02 
 
 
1052 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  22.52 
 
 
259 aa  41.6  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>