114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4476 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  100 
 
 		 267 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  58.82 
 
 		 286 aa  298  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  56.64 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  55.86 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  55.81 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  56.98 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  52.83 
 
 		 351 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  56.35 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  53.38 
 
 		 266 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  53.49 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  56.11 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  55.22 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  55.22 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  55.22 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  56.75 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  54.05 
 
 		 303 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  54.05 
 
 		 334 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  51.18 
 
 		 323 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  53.36 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  55 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  53.49 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  53.7 
 
 		 278 aa  265  7e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  50.4 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  49.41 
 
 		 284 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  50.39 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  49.43 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  47.57 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  53.39 
 
 		 295 aa  252  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  48.24 
 
 		 280 aa  251  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  42.69 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  34.87 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  29.06 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  31.4 
 
 		 615 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 		 1019 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.56 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  29.82 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  27.02 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  27.38 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  25.78 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  27.67 
 
 		 543 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  28.96 
 
 		 387 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  30.59 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  25.38 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 1016 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  21.97 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  27.88 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  28.68 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  28.15 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  28.5 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  28.07 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  29.23 
 
 		 1051 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  29.23 
 
 		 1051 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  29.23 
 
 		 1051 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  29.18 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  29.25 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  29.18 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  29.18 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  29.3 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 		 1094 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  27.38 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 1052 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  28.65 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1310  hypothetical protein  21.46 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.251322  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 1059 aa  56.2  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  28.11 
 
 		 788 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  27.37 
 
 		 788 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  27.57 
 
 		 788 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  33.33 
 
 		 988 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  28.06 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  25 
 
 		 781 aa  53.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  26.24 
 
 		 1055 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  28.09 
 
 		 803 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 1048 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1535  hypothetical protein  21.51 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  33.59 
 
 		 1038 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1263  hypothetical protein  21.12 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.217643  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  26.26 
 
 		 786 aa  50.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1466  hypothetical protein  21.12 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1265  hypothetical protein  21.12 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.82 
 
 		 1124 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1291  hypothetical protein  21.12 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1395  hypothetical protein  20.8 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  28.16 
 
 		 976 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3915  hypothetical protein  21.12 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.12 
 
 		 958 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  30.89 
 
 		 1099 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1493  hypothetical protein  21.81 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  23.97 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 1038 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  28.06 
 
 		 1076 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  27.41 
 
 		 1095 aa  46.2  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 1349 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  22.14 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1429  hypothetical protein  22.39 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1299  hypothetical protein  20.72 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0504413  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  32.26 
 
 		 993 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  27.78 
 
 		 783 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  25.12 
 
 		 607 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  29.71 
 
 		 951 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>