79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  53.9 
 
 		 279 aa  314  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  49.19 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  49.26 
 
 		 276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  45 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  45.64 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  45.94 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  46.48 
 
 		 302 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  46.26 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  51.16 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  29.03 
 
 		 351 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  28.46 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  30.88 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  28.36 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  29.21 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  28.03 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  28.62 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  30.57 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  30.57 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  30.57 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  29.74 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.18 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  26.73 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  28.22 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  29.32 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  26.62 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  27.38 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  29.04 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  30.3 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  23.08 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  30.83 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  26.89 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  26.57 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  27.05 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  28.24 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  26.62 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  28.96 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  26.02 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  25.66 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  27.47 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  27.34 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  25.36 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  27.2 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  29.96 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  29.63 
 
 		 1038 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  25.67 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  21.37 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  27.21 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  22.81 
 
 		 1019 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  21.93 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.24 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.24 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  26.77 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  26.97 
 
 		 1055 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  26.16 
 
 		 387 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  19.27 
 
 		 781 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 		 1038 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  25.62 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.14 
 
 		 1051 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  26.33 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  23.23 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 		 1051 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  29.08 
 
 		 864 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  25.49 
 
 		 1052 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  24.59 
 
 		 780 aa  47  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 921 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  24.41 
 
 		 1129 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 1134 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  25.65 
 
 		 1197 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.18 
 
 		 1066 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  38.64 
 
 		 1099 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1018 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 1098 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  29.56 
 
 		 984 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.76 
 
 		 1016 aa  42.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  38.24 
 
 		 1050 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  22.68 
 
 		 1059 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>