14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1310 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.251322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  20.68 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  21.46 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  19.92 
 
 		 303 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  21.67 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  22.05 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 1016 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1736  hypothetical protein  36.67 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  19.77 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  23.83 
 
 		 783 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1358  DNA helicase II  22.48 
 
 		 387 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.248341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  19.38 
 
 		 263 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  20.58 
 
 		 333 aa  42  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  20.91 
 
 		 323 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>