37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2712 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  100 
 
 
543 aa  1102    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  36.14 
 
 
615 aa  267  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  30.12 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  28.79 
 
 
303 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  28.09 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  28.29 
 
 
295 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  27.86 
 
 
299 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  27.05 
 
 
267 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  27.91 
 
 
286 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  27.37 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  26.39 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  27.87 
 
 
323 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 
302 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  24.51 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  26.47 
 
 
304 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  25.84 
 
 
291 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  25.19 
 
 
278 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  25.91 
 
 
351 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  26.35 
 
 
284 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  27.7 
 
 
322 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  26.3 
 
 
313 aa  60.1  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  23.86 
 
 
266 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  25.83 
 
 
273 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  26.39 
 
 
387 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  25.38 
 
 
280 aa  57.4  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  25.66 
 
 
303 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  25.71 
 
 
294 aa  56.2  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  25.63 
 
 
277 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  25.63 
 
 
277 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  25.63 
 
 
277 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  24.82 
 
 
320 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  26.12 
 
 
387 aa  47  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  24.09 
 
 
298 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  27.78 
 
 
259 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  25.84 
 
 
387 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  25.84 
 
 
387 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  25.47 
 
 
387 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>